Protein–RNA interactions for Protein: Q2MKA5

Chrna5, Neuronal acetylcholine receptor subunit alpha-5, mousemouse

Predictions only

Length 467 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chrna5Q2MKA5 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC29.93■■■□□ 2.38
Chrna5Q2MKA5 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
Chrna5Q2MKA5 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
Chrna5Q2MKA5 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC29.92■■■□□ 2.38
Chrna5Q2MKA5 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC29.92■■■□□ 2.38
Chrna5Q2MKA5 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
Chrna5Q2MKA5 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
Chrna5Q2MKA5 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
Chrna5Q2MKA5 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.9■■■□□ 2.38
Chrna5Q2MKA5 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC29.88■■■□□ 2.37
Chrna5Q2MKA5 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
Chrna5Q2MKA5 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC29.87■■■□□ 2.37
Chrna5Q2MKA5 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
Chrna5Q2MKA5 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
Chrna5Q2MKA5 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC29.86■■■□□ 2.37
Chrna5Q2MKA5 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC29.85■■■□□ 2.37
Chrna5Q2MKA5 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
Chrna5Q2MKA5 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
Chrna5Q2MKA5 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
Chrna5Q2MKA5 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC29.84■■■□□ 2.37
Chrna5Q2MKA5 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
Chrna5Q2MKA5 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
Chrna5Q2MKA5 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
Chrna5Q2MKA5 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
Chrna5Q2MKA5 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC29.83■■■□□ 2.37
Chrna5Q2MKA5 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
Chrna5Q2MKA5 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC29.82■■■□□ 2.36
Chrna5Q2MKA5 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
Chrna5Q2MKA5 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.81■■■□□ 2.36
Chrna5Q2MKA5 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
Chrna5Q2MKA5 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
Chrna5Q2MKA5 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
Chrna5Q2MKA5 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC29.78■■■□□ 2.36
Chrna5Q2MKA5 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC29.75■■■□□ 2.35
Chrna5Q2MKA5 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
Chrna5Q2MKA5 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
Chrna5Q2MKA5 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC29.74■■■□□ 2.35
Chrna5Q2MKA5 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
Chrna5Q2MKA5 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
Chrna5Q2MKA5 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
Chrna5Q2MKA5 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC29.72■■■□□ 2.35
Chrna5Q2MKA5 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
Chrna5Q2MKA5 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
Chrna5Q2MKA5 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC29.71■■■□□ 2.35
Chrna5Q2MKA5 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
Chrna5Q2MKA5 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC29.68■■■□□ 2.34
Chrna5Q2MKA5 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC29.67■■■□□ 2.34
Chrna5Q2MKA5 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
Chrna5Q2MKA5 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.67■■■□□ 2.34
Chrna5Q2MKA5 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
Chrna5Q2MKA5 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
Chrna5Q2MKA5 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.66■■■□□ 2.34
Chrna5Q2MKA5 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
Chrna5Q2MKA5 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
Chrna5Q2MKA5 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
Chrna5Q2MKA5 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC29.63■■■□□ 2.33
Chrna5Q2MKA5 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
Chrna5Q2MKA5 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
Chrna5Q2MKA5 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
Chrna5Q2MKA5 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
Chrna5Q2MKA5 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC29.6■■■□□ 2.33
Chrna5Q2MKA5 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
Chrna5Q2MKA5 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
Chrna5Q2MKA5 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.59■■■□□ 2.33
Chrna5Q2MKA5 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
Chrna5Q2MKA5 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
Chrna5Q2MKA5 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.57■■■□□ 2.32
Chrna5Q2MKA5 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.57■■■□□ 2.32
Chrna5Q2MKA5 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.56■■■□□ 2.32
Chrna5Q2MKA5 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
Chrna5Q2MKA5 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
Chrna5Q2MKA5 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
Chrna5Q2MKA5 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
Chrna5Q2MKA5 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
Chrna5Q2MKA5 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC29.55■■■□□ 2.32
Chrna5Q2MKA5 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC29.55■■■□□ 2.32
Chrna5Q2MKA5 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
Chrna5Q2MKA5 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC29.53■■■□□ 2.32
Chrna5Q2MKA5 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC29.52■■■□□ 2.32
Chrna5Q2MKA5 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
Chrna5Q2MKA5 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
Chrna5Q2MKA5 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
Chrna5Q2MKA5 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC29.5■■■□□ 2.31
Chrna5Q2MKA5 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.49■■■□□ 2.31
Chrna5Q2MKA5 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC29.48■■■□□ 2.31
Chrna5Q2MKA5 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
Chrna5Q2MKA5 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC29.47■■■□□ 2.31
Chrna5Q2MKA5 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
Chrna5Q2MKA5 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC29.46■■■□□ 2.31
Chrna5Q2MKA5 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.46■■■□□ 2.31
Chrna5Q2MKA5 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC29.45■■■□□ 2.31
Chrna5Q2MKA5 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
Chrna5Q2MKA5 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
Chrna5Q2MKA5 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.42■■■□□ 2.3
Chrna5Q2MKA5 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
Chrna5Q2MKA5 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC29.41■■■□□ 2.3
Chrna5Q2MKA5 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC29.39■■■□□ 2.3
Chrna5Q2MKA5 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC29.39■■■□□ 2.3
Chrna5Q2MKA5 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
Chrna5Q2MKA5 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC29.37■■■□□ 2.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.8 ms