Protein–RNA interactions for Protein: Q12527

ATG11, Autophagy-related protein 11, yeastyeast

Predictions only

Length 1,178 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
ATG11Q12527 YPS3YLR121C 1527 nt9.57□□□□□ -0.88
ATG11Q12527 QDR2YIL121W 1629 nt9.57□□□□□ -0.88
ATG11Q12527 SOL2YCR073W-A 948 nt9.57□□□□□ -0.88
ATG11Q12527 YGR139WYGR139W 339 nt9.57□□□□□ -0.88
ATG11Q12527 KRE1YNL322C 942 nt9.57□□□□□ -0.88
ATG11Q12527 RSC8YFR037C 1674 nt9.57□□□□□ -0.88
ATG11Q12527 RIM8YGL045W 1629 nt9.56□□□□□ -0.88
ATG11Q12527 FMS1YMR020W 1527 nt9.56□□□□□ -0.88
ATG11Q12527 YFR036W-AYFR036W-A 651 nt9.55□□□□□ -0.88
ATG11Q12527 NAS2YIL007C 663 nt9.55□□□□□ -0.88
ATG11Q12527 HEM13YDR044W 987 nt9.54□□□□□ -0.88
ATG11Q12527 HEL2YDR266C 1920 nt9.52□□□□□ -0.88
ATG11Q12527 ACO2YJL200C 2370 nt9.52□□□□□ -0.88
ATG11Q12527 SWM1YDR260C 513 nt9.52□□□□□ -0.89
ATG11Q12527 YJL067WYJL067W 351 nt9.52□□□□□ -0.89
ATG11Q12527 MUP1YGR055W 1725 nt9.51□□□□□ -0.89
ATG11Q12527 LYS20YDL182W 1287 nt9.5□□□□□ -0.89
ATG11Q12527 TAT2YOL020W 1779 nt9.5□□□□□ -0.89
ATG11Q12527 YDR455CYDR455C 309 nt9.49□□□□□ -0.89
ATG11Q12527 BUD20YLR074C 501 nt9.49□□□□□ -0.89
ATG11Q12527 RRT8YOL048C 1029 nt9.49□□□□□ -0.89
ATG11Q12527 FLX1YIL134W 936 nt9.48□□□□□ -0.89
ATG11Q12527 SPP2YOR148C 558 nt9.48□□□□□ -0.89
ATG11Q12527 YGL114WYGL114W 2178 nt9.48□□□□□ -0.89
ATG11Q12527 ABZ2YMR289W 1125 nt9.47□□□□□ -0.89
ATG11Q12527 ADE8YDR408C 645 nt9.46□□□□□ -0.9
ATG11Q12527 THP3YPR045C 1413 nt9.46□□□□□ -0.9
ATG11Q12527 HOL1YNR055C 1761 nt9.45□□□□□ -0.9
ATG11Q12527 TVP23YDR084C 600 nt9.44□□□□□ -0.9
ATG11Q12527 SPE2YOL052C 1191 nt9.44□□□□□ -0.9
ATG11Q12527 FRE6YLL051C 2139 nt9.43□□□□□ -0.9
ATG11Q12527 ASP3-1YLR155C 1089 nt9.42□□□□□ -0.9
ATG11Q12527 ASP3-2YLR157C 1089 nt9.42□□□□□ -0.9
ATG11Q12527 ASP3-3YLR158C 1089 nt9.42□□□□□ -0.9
ATG11Q12527 ASP3-4YLR160C 1089 nt9.42□□□□□ -0.9
ATG11Q12527 ACH1YBL015W 1581 nt9.41□□□□□ -0.9
ATG11Q12527 ERG13YML126C 1476 nt9.41□□□□□ -0.9
ATG11Q12527 CWC15YDR163W 528 nt9.41□□□□□ -0.9
ATG11Q12527 PHB2YGR231C 933 nt9.41□□□□□ -0.9
ATG11Q12527 YMR007WYMR007W 381 nt9.41□□□□□ -0.9
ATG11Q12527 ADH3YMR083W 1128 nt9.4□□□□□ -0.9
ATG11Q12527 ILV3YJR016C 1758 nt9.4□□□□□ -0.91
ATG11Q12527 SER2YGR208W 930 nt9.38□□□□□ -0.91
ATG11Q12527 FSH2YMR222C 672 nt9.38□□□□□ -0.91
ATG11Q12527 OPI3YJR073C 621 nt9.37□□□□□ -0.91
ATG11Q12527 MOB1YIL106W 945 nt9.36□□□□□ -0.91
ATG11Q12527 RCR1YBR005W 642 nt9.36□□□□□ -0.91
ATG11Q12527 VPS62YGR141W 1404 nt9.36□□□□□ -0.91
ATG11Q12527 YIL100C-AYIL100C-A 339 nt9.35□□□□□ -0.91
ATG11Q12527 CYC3YAL039C 810 nt9.34□□□□□ -0.91
ATG11Q12527 YOR325WYOR325W 474 nt9.34□□□□□ -0.91
ATG11Q12527 BET2YPR176C 978 nt9.33□□□□□ -0.92
ATG11Q12527 ENO2YHR174W 1314 nt9.31□□□□□ -0.92
ATG11Q12527 HTS1YPR033C 1641 nt9.31□□□□□ -0.92
ATG11Q12527 TPC1YGR096W 945 nt9.31□□□□□ -0.92
ATG11Q12527 YOR343CYOR343C 327 nt9.31□□□□□ -0.92
ATG11Q12527 PAU21YOR394W 495 nt9.3□□□□□ -0.92
ATG11Q12527 PAU22YPL282C 495 nt9.3□□□□□ -0.92
ATG11Q12527 YDL086WYDL086W 822 nt9.29□□□□□ -0.92
ATG11Q12527 AMF1YOR378W 1548 nt9.29□□□□□ -0.92
ATG11Q12527 HIS2YFR025C 1008 nt9.28□□□□□ -0.92
ATG11Q12527 DIG1YPL049C 1359 nt9.27□□□□□ -0.93
ATG11Q12527 SAC7YDR389W 1965 nt9.27□□□□□ -0.93
ATG11Q12527 RPL12BYDR418W 498 nt9.27□□□□□ -0.93
ATG11Q12527 YKR012CYKR012C 378 nt9.27□□□□□ -0.93
ATG11Q12527 GID7YCL039W 2238 nt9.27□□□□□ -0.93
ATG11Q12527 MAE1YKL029C 2010 nt9.26□□□□□ -0.93
ATG11Q12527 OPI10YOL032W 741 nt9.26□□□□□ -0.93
ATG11Q12527 COQ8YGL119W 1506 nt9.26□□□□□ -0.93
ATG11Q12527 TGA1tA(UGC)A 73 nt9.24□□□□□ -0.93
ATG11Q12527 tA(UGC)EtA(UGC)E 73 nt9.24□□□□□ -0.93
ATG11Q12527 tA(UGC)GtA(UGC)G 73 nt9.24□□□□□ -0.93
ATG11Q12527 tA(UGC)LtA(UGC)L 73 nt9.24□□□□□ -0.93
ATG11Q12527 tA(UGC)OtA(UGC)O 73 nt9.24□□□□□ -0.93
ATG11Q12527 PCP1YGR101W 1041 nt9.24□□□□□ -0.93
ATG11Q12527 YAL016C-AYAL016C-A 315 nt9.24□□□□□ -0.93
ATG11Q12527 AIM1YAL046C 357 nt9.24□□□□□ -0.93
ATG11Q12527 LSB6YJL100W 1824 nt9.24□□□□□ -0.93
ATG11Q12527 HRA1HRA1 564 nt9.23□□□□□ -0.93
ATG11Q12527 LEU2YCL018W 1095 nt9.23□□□□□ -0.93
ATG11Q12527 CCT2YIL142W 1584 nt9.23□□□□□ -0.93
ATG11Q12527 YMR209CYMR209C 1374 nt9.23□□□□□ -0.93
ATG11Q12527 MET2YNL277W 1461 nt9.22□□□□□ -0.93
ATG11Q12527 YGR210CYGR210C 1236 nt9.22□□□□□ -0.93
ATG11Q12527 SRP102YKL154W 735 nt9.22□□□□□ -0.93
ATG11Q12527 ARO8YGL202W 1503 nt9.21□□□□□ -0.93
ATG11Q12527 SDS24YBR214W 1584 nt9.21□□□□□ -0.93
ATG11Q12527 GRH1YDR517W 1119 nt9.21□□□□□ -0.94
ATG11Q12527 FCY1YPR062W 477 nt9.21□□□□□ -0.94
ATG11Q12527 NAM8YHR086W 1572 nt9.2□□□□□ -0.94
ATG11Q12527 ERO1YML130C 1692 nt9.2□□□□□ -0.94
ATG11Q12527 YNR064CYNR064C 873 nt9.19□□□□□ -0.94
ATG11Q12527 UGP1YKL035W 1500 nt9.19□□□□□ -0.94
ATG11Q12527 ENO1YGR254W 1314 nt9.18□□□□□ -0.94
ATG11Q12527 ENT4YLL038C 744 nt9.18□□□□□ -0.94
ATG11Q12527 YLR280CYLR280C 351 nt9.18□□□□□ -0.94
ATG11Q12527 KES1YPL145C 1305 nt9.18□□□□□ -0.94
ATG11Q12527 YOR268CYOR268C 399 nt9.15□□□□□ -0.94
ATG11Q12527 VBA3YCL069W 1377 nt9.14□□□□□ -0.95
ATG11Q12527 SGA1YIL099W 1650 nt9.14□□□□□ -0.95
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 16.5 ms