Protein–RNA interactions for Protein: Q12173

TY3A-G, Transposon Ty3-G Gag polyprotein, yeastyeast

Predictions only

Length 290 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
TY3A-GQ12173 OSH7YHR001W 1314 nt9.81□□□□□ -0.84
TY3A-GQ12173 NAS2YIL007C 663 nt9.78□□□□□ -0.84
TY3A-GQ12173 DLD2YDL178W 1593 nt9.77□□□□□ -0.85
TY3A-GQ12173 CDD1YLR245C 429 nt9.77□□□□□ -0.85
TY3A-GQ12173 PAU21YOR394W 495 nt9.77□□□□□ -0.85
TY3A-GQ12173 PAU22YPL282C 495 nt9.77□□□□□ -0.85
TY3A-GQ12173 HRA1HRA1 564 nt9.76□□□□□ -0.85
TY3A-GQ12173 SPE2YOL052C 1191 nt9.76□□□□□ -0.85
TY3A-GQ12173 YOR268CYOR268C 399 nt9.76□□□□□ -0.85
TY3A-GQ12173 SER2YGR208W 930 nt9.75□□□□□ -0.85
TY3A-GQ12173 THP3YPR045C 1413 nt9.74□□□□□ -0.85
TY3A-GQ12173 SOL2YCR073W-A 948 nt9.74□□□□□ -0.85
TY3A-GQ12173 CYC3YAL039C 810 nt9.74□□□□□ -0.85
TY3A-GQ12173 ABZ2YMR289W 1125 nt9.74□□□□□ -0.85
TY3A-GQ12173 YAT1YAR035W 2064 nt9.73□□□□□ -0.85
TY3A-GQ12173 HTS1YPR033C 1641 nt9.72□□□□□ -0.85
TY3A-GQ12173 MOB1YIL106W 945 nt9.72□□□□□ -0.85
TY3A-GQ12173 RSC8YFR037C 1674 nt9.71□□□□□ -0.85
TY3A-GQ12173 YFR036W-AYFR036W-A 651 nt9.71□□□□□ -0.86
TY3A-GQ12173 FSH2YMR222C 672 nt9.71□□□□□ -0.86
TY3A-GQ12173 BET2YPR176C 978 nt9.71□□□□□ -0.86
TY3A-GQ12173 ADE8YDR408C 645 nt9.7□□□□□ -0.86
TY3A-GQ12173 PCP1YGR101W 1041 nt9.69□□□□□ -0.86
TY3A-GQ12173 ADH3YMR083W 1128 nt9.69□□□□□ -0.86
TY3A-GQ12173 FLR1YBR008C 1647 nt9.69□□□□□ -0.86
TY3A-GQ12173 HSL7YBR133C 2484 nt9.69□□□□□ -0.86
TY3A-GQ12173 ZRT3YKL175W 1512 nt9.68□□□□□ -0.86
TY3A-GQ12173 MFG1YDL233W 1377 nt9.68□□□□□ -0.86
TY3A-GQ12173 TOS1YBR162C 1368 nt9.68□□□□□ -0.86
TY3A-GQ12173 GRH1YDR517W 1119 nt9.68□□□□□ -0.86
TY3A-GQ12173 TVP23YDR084C 600 nt9.66□□□□□ -0.86
TY3A-GQ12173 PHB2YGR231C 933 nt9.66□□□□□ -0.86
TY3A-GQ12173 RRT8YOL048C 1029 nt9.66□□□□□ -0.86
TY3A-GQ12173 YPS3YLR121C 1527 nt9.64□□□□□ -0.87
TY3A-GQ12173 ENO2YHR174W 1314 nt9.63□□□□□ -0.87
TY3A-GQ12173 FCY1YPR062W 477 nt9.62□□□□□ -0.87
TY3A-GQ12173 HOG1YLR113W 1308 nt9.61□□□□□ -0.87
TY3A-GQ12173 ASP3-1YLR155C 1089 nt9.6□□□□□ -0.87
TY3A-GQ12173 ASP3-2YLR157C 1089 nt9.6□□□□□ -0.87
TY3A-GQ12173 ASP3-3YLR158C 1089 nt9.6□□□□□ -0.87
TY3A-GQ12173 ASP3-4YLR160C 1089 nt9.6□□□□□ -0.87
TY3A-GQ12173 FMS1YMR020W 1527 nt9.6□□□□□ -0.87
TY3A-GQ12173 TGA1tA(UGC)A 73 nt9.59□□□□□ -0.87
TY3A-GQ12173 tA(UGC)EtA(UGC)E 73 nt9.59□□□□□ -0.87
TY3A-GQ12173 tA(UGC)GtA(UGC)G 73 nt9.59□□□□□ -0.87
TY3A-GQ12173 tA(UGC)LtA(UGC)L 73 nt9.59□□□□□ -0.87
TY3A-GQ12173 tA(UGC)OtA(UGC)O 73 nt9.59□□□□□ -0.87
TY3A-GQ12173 SPP2YOR148C 558 nt9.59□□□□□ -0.87
TY3A-GQ12173 HEM13YDR044W 987 nt9.57□□□□□ -0.88
TY3A-GQ12173 YKR012CYKR012C 378 nt9.57□□□□□ -0.88
TY3A-GQ12173 DIG1YPL049C 1359 nt9.57□□□□□ -0.88
TY3A-GQ12173 YDR455CYDR455C 309 nt9.56□□□□□ -0.88
TY3A-GQ12173 TPC1YGR096W 945 nt9.56□□□□□ -0.88
TY3A-GQ12173 YGR210CYGR210C 1236 nt9.56□□□□□ -0.88
TY3A-GQ12173 ERG13YML126C 1476 nt9.55□□□□□ -0.88
TY3A-GQ12173 SPT20YOL148C 1815 nt9.55□□□□□ -0.88
TY3A-GQ12173 SRP102YKL154W 735 nt9.55□□□□□ -0.88
TY3A-GQ12173 TAT2YOL020W 1779 nt9.53□□□□□ -0.88
TY3A-GQ12173 CWC15YDR163W 528 nt9.53□□□□□ -0.88
TY3A-GQ12173 MRP1YDR347W 966 nt9.53□□□□□ -0.88
TY3A-GQ12173 ENO1YGR254W 1314 nt9.53□□□□□ -0.88
TY3A-GQ12173 AMF1YOR378W 1548 nt9.52□□□□□ -0.88
TY3A-GQ12173 EDC2YER035W 438 nt9.52□□□□□ -0.89
TY3A-GQ12173 RIM2YBR192W 1134 nt9.52□□□□□ -0.89
TY3A-GQ12173 ERO1YML130C 1692 nt9.51□□□□□ -0.89
TY3A-GQ12173 EMC3YKL207W 762 nt9.51□□□□□ -0.89
TY3A-GQ12173 YLR280CYLR280C 351 nt9.51□□□□□ -0.89
TY3A-GQ12173 LEU2YCL018W 1095 nt9.51□□□□□ -0.89
TY3A-GQ12173 VPS62YGR141W 1404 nt9.5□□□□□ -0.89
TY3A-GQ12173 OPI3YJR073C 621 nt9.5□□□□□ -0.89
TY3A-GQ12173 BSP1YPR171W 1731 nt9.49□□□□□ -0.89
TY3A-GQ12173 YMR206WYMR206W 942 nt9.49□□□□□ -0.89
TY3A-GQ12173 LSB6YJL100W 1824 nt9.48□□□□□ -0.89
TY3A-GQ12173 INA1YLR413W 2028 nt9.48□□□□□ -0.89
TY3A-GQ12173 RPC82YPR190C 1965 nt9.47□□□□□ -0.89
TY3A-GQ12173 YJL067WYJL067W 351 nt9.47□□□□□ -0.89
TY3A-GQ12173 SDH8YBR269C 417 nt9.46□□□□□ -0.9
TY3A-GQ12173 SDS24YBR214W 1584 nt9.46□□□□□ -0.9
TY3A-GQ12173 RDN25-1RDN25-1 3396 nt9.45□□□□□ -0.9
TY3A-GQ12173 RDN25-2RDN25-2 3396 nt9.45□□□□□ -0.9
TY3A-GQ12173 KAE1YKR038C 1161 nt9.44□□□□□ -0.9
TY3A-GQ12173 YPL108WYPL108W 507 nt9.44□□□□□ -0.9
TY3A-GQ12173 YMR210WYMR210W 1350 nt9.42□□□□□ -0.9
TY3A-GQ12173 YDL086WYDL086W 822 nt9.42□□□□□ -0.9
TY3A-GQ12173 YJL160CYJL160C 864 nt9.42□□□□□ -0.9
TY3A-GQ12173 HEL2YDR266C 1920 nt9.41□□□□□ -0.9
TY3A-GQ12173 NAM8YHR086W 1572 nt9.41□□□□□ -0.9
TY3A-GQ12173 PRE5YMR314W 705 nt9.4□□□□□ -0.9
TY3A-GQ12173 GDH1YOR375C 1365 nt9.39□□□□□ -0.91
TY3A-GQ12173 ACH1YBL015W 1581 nt9.38□□□□□ -0.91
TY3A-GQ12173 tL(UAA)B1tL(UAA)B1 84 nt9.38□□□□□ -0.91
TY3A-GQ12173 tL(UAA)B2tL(UAA)B2 84 nt9.38□□□□□ -0.91
TY3A-GQ12173 tL(UAA)DtL(UAA)D 84 nt9.38□□□□□ -0.91
TY3A-GQ12173 SUP51tL(UAA)J 84 nt9.38□□□□□ -0.91
TY3A-GQ12173 tL(UAA)KtL(UAA)K 84 nt9.38□□□□□ -0.91
TY3A-GQ12173 tL(UAA)LtL(UAA)L 84 nt9.38□□□□□ -0.91
TY3A-GQ12173 tL(UAA)NtL(UAA)N 84 nt9.38□□□□□ -0.91
TY3A-GQ12173 VBA3YCL069W 1377 nt9.37□□□□□ -0.91
TY3A-GQ12173 BAP3YDR046C 1815 nt9.36□□□□□ -0.91
TY3A-GQ12173 YNR064CYNR064C 873 nt9.36□□□□□ -0.91
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