Protein–RNA interactions for Protein: Q0VF55

Atp2b3, Calcium-transporting ATPase, mousemouse

Predictions only

Length 1,220 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp2b3Q0VF55 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
Atp2b3Q0VF55 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
Atp2b3Q0VF55 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
Atp2b3Q0VF55 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
Atp2b3Q0VF55 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
Atp2b3Q0VF55 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
Atp2b3Q0VF55 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
Atp2b3Q0VF55 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC29.85■■■□□ 2.37
Atp2b3Q0VF55 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
Atp2b3Q0VF55 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC29.83■■■□□ 2.37
Atp2b3Q0VF55 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
Atp2b3Q0VF55 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
Atp2b3Q0VF55 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
Atp2b3Q0VF55 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
Atp2b3Q0VF55 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.8■■■□□ 2.36
Atp2b3Q0VF55 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC29.79■■■□□ 2.36
Atp2b3Q0VF55 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.78■■■□□ 2.36
Atp2b3Q0VF55 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
Atp2b3Q0VF55 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
Atp2b3Q0VF55 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC29.76■■■□□ 2.36
Atp2b3Q0VF55 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
Atp2b3Q0VF55 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
Atp2b3Q0VF55 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC29.75■■■□□ 2.35
Atp2b3Q0VF55 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC29.74■■■□□ 2.35
Atp2b3Q0VF55 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
Atp2b3Q0VF55 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC29.73■■■□□ 2.35
Atp2b3Q0VF55 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
Atp2b3Q0VF55 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC29.71■■■□□ 2.35
Atp2b3Q0VF55 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
Atp2b3Q0VF55 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
Atp2b3Q0VF55 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
Atp2b3Q0VF55 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
Atp2b3Q0VF55 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
Atp2b3Q0VF55 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
Atp2b3Q0VF55 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
Atp2b3Q0VF55 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
Atp2b3Q0VF55 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.68■■■□□ 2.34
Atp2b3Q0VF55 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC29.68■■■□□ 2.34
Atp2b3Q0VF55 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.68■■■□□ 2.34
Atp2b3Q0VF55 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
Atp2b3Q0VF55 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
Atp2b3Q0VF55 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
Atp2b3Q0VF55 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
Atp2b3Q0VF55 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC29.65■■■□□ 2.34
Atp2b3Q0VF55 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.65■■■□□ 2.34
Atp2b3Q0VF55 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
Atp2b3Q0VF55 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC29.64■■■□□ 2.34
Atp2b3Q0VF55 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
Atp2b3Q0VF55 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC29.63■■■□□ 2.33
Atp2b3Q0VF55 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
Atp2b3Q0VF55 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
Atp2b3Q0VF55 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC29.61■■■□□ 2.33
Atp2b3Q0VF55 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
Atp2b3Q0VF55 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
Atp2b3Q0VF55 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.6■■■□□ 2.33
Atp2b3Q0VF55 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
Atp2b3Q0VF55 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
Atp2b3Q0VF55 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
Atp2b3Q0VF55 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
Atp2b3Q0VF55 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.58■■■□□ 2.33
Atp2b3Q0VF55 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
Atp2b3Q0VF55 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC29.57■■■□□ 2.32
Atp2b3Q0VF55 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
Atp2b3Q0VF55 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
Atp2b3Q0VF55 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
Atp2b3Q0VF55 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.55■■■□□ 2.32
Atp2b3Q0VF55 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
Atp2b3Q0VF55 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
Atp2b3Q0VF55 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
Atp2b3Q0VF55 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC29.53■■■□□ 2.32
Atp2b3Q0VF55 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
Atp2b3Q0VF55 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
Atp2b3Q0VF55 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
Atp2b3Q0VF55 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.32
Atp2b3Q0VF55 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC29.51■■■□□ 2.31
Atp2b3Q0VF55 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
Atp2b3Q0VF55 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC29.5■■■□□ 2.31
Atp2b3Q0VF55 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
Atp2b3Q0VF55 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC29.49■■■□□ 2.31
Atp2b3Q0VF55 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.48■■■□□ 2.31
Atp2b3Q0VF55 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC29.48■■■□□ 2.31
Atp2b3Q0VF55 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
Atp2b3Q0VF55 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
Atp2b3Q0VF55 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
Atp2b3Q0VF55 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC29.47■■■□□ 2.31
Atp2b3Q0VF55 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
Atp2b3Q0VF55 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
Atp2b3Q0VF55 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.45■■■□□ 2.31
Atp2b3Q0VF55 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
Atp2b3Q0VF55 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
Atp2b3Q0VF55 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC29.44■■■□□ 2.3
Atp2b3Q0VF55 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
Atp2b3Q0VF55 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
Atp2b3Q0VF55 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
Atp2b3Q0VF55 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
Atp2b3Q0VF55 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC29.43■■■□□ 2.3
Atp2b3Q0VF55 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
Atp2b3Q0VF55 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.42■■■□□ 2.3
Atp2b3Q0VF55 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC29.42■■■□□ 2.3
Atp2b3Q0VF55 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.3 ms