Protein–RNA interactions for Protein: Q0V8T9

Cntnap5a, Contactin-associated protein like 5-1, mousemouse

Predictions only

Length 1,304 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cntnap5aQ0V8T9 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Cntnap5aQ0V8T9 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Cntnap5aQ0V8T9 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
Cntnap5aQ0V8T9 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Cntnap5aQ0V8T9 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
Cntnap5aQ0V8T9 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Cntnap5aQ0V8T9 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Cntnap5aQ0V8T9 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
Cntnap5aQ0V8T9 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
Cntnap5aQ0V8T9 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.79
Cntnap5aQ0V8T9 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC26.2■■□□□ 1.79
Cntnap5aQ0V8T9 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.2■■□□□ 1.79
Cntnap5aQ0V8T9 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Cntnap5aQ0V8T9 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Cntnap5aQ0V8T9 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Cntnap5aQ0V8T9 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Cntnap5aQ0V8T9 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
Cntnap5aQ0V8T9 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Cntnap5aQ0V8T9 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Cntnap5aQ0V8T9 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Cntnap5aQ0V8T9 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Cntnap5aQ0V8T9 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Cntnap5aQ0V8T9 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
Cntnap5aQ0V8T9 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Cntnap5aQ0V8T9 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
Cntnap5aQ0V8T9 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.77
Cntnap5aQ0V8T9 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Cntnap5aQ0V8T9 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Cntnap5aQ0V8T9 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Cntnap5aQ0V8T9 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Cntnap5aQ0V8T9 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
Cntnap5aQ0V8T9 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Cntnap5aQ0V8T9 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Cntnap5aQ0V8T9 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Cntnap5aQ0V8T9 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Cntnap5aQ0V8T9 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Cntnap5aQ0V8T9 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Cntnap5aQ0V8T9 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Cntnap5aQ0V8T9 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Cntnap5aQ0V8T9 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Cntnap5aQ0V8T9 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Cntnap5aQ0V8T9 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Cntnap5aQ0V8T9 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Cntnap5aQ0V8T9 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Cntnap5aQ0V8T9 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Cntnap5aQ0V8T9 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Cntnap5aQ0V8T9 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Cntnap5aQ0V8T9 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Cntnap5aQ0V8T9 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Cntnap5aQ0V8T9 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Cntnap5aQ0V8T9 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
Cntnap5aQ0V8T9 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Cntnap5aQ0V8T9 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC26■■□□□ 1.75
Cntnap5aQ0V8T9 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Cntnap5aQ0V8T9 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC26■■□□□ 1.75
Cntnap5aQ0V8T9 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Cntnap5aQ0V8T9 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Cntnap5aQ0V8T9 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Cntnap5aQ0V8T9 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Cntnap5aQ0V8T9 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Cntnap5aQ0V8T9 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Cntnap5aQ0V8T9 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Cntnap5aQ0V8T9 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Cntnap5aQ0V8T9 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Cntnap5aQ0V8T9 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Cntnap5aQ0V8T9 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
Cntnap5aQ0V8T9 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Cntnap5aQ0V8T9 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
Cntnap5aQ0V8T9 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
Cntnap5aQ0V8T9 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
Cntnap5aQ0V8T9 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
Cntnap5aQ0V8T9 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.75
Cntnap5aQ0V8T9 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
Cntnap5aQ0V8T9 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Cntnap5aQ0V8T9 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Cntnap5aQ0V8T9 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Cntnap5aQ0V8T9 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Cntnap5aQ0V8T9 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Cntnap5aQ0V8T9 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Cntnap5aQ0V8T9 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
Cntnap5aQ0V8T9 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Cntnap5aQ0V8T9 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Cntnap5aQ0V8T9 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Cntnap5aQ0V8T9 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Cntnap5aQ0V8T9 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Cntnap5aQ0V8T9 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Cntnap5aQ0V8T9 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Cntnap5aQ0V8T9 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Cntnap5aQ0V8T9 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
Cntnap5aQ0V8T9 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Cntnap5aQ0V8T9 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Cntnap5aQ0V8T9 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Cntnap5aQ0V8T9 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Cntnap5aQ0V8T9 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Cntnap5aQ0V8T9 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Cntnap5aQ0V8T9 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Cntnap5aQ0V8T9 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Cntnap5aQ0V8T9 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Cntnap5aQ0V8T9 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
Cntnap5aQ0V8T9 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.1 ms