Protein–RNA interactions for Protein: Q09324

Gcnt1, Beta-1,3-galactosyl-O-glycosyl-glycoprotein beta-1,6-N-acetylglucosaminyltransferase, mousemouse

Predictions only

Length 428 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gcnt1Q09324 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Gcnt1Q09324 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
Gcnt1Q09324 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Gcnt1Q09324 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Gcnt1Q09324 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Gcnt1Q09324 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Gcnt1Q09324 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Gcnt1Q09324 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Gcnt1Q09324 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Gcnt1Q09324 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Gcnt1Q09324 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Gcnt1Q09324 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Gcnt1Q09324 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Gcnt1Q09324 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Gcnt1Q09324 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Gcnt1Q09324 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Gcnt1Q09324 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
Gcnt1Q09324 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
Gcnt1Q09324 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Gcnt1Q09324 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Gcnt1Q09324 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Gcnt1Q09324 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Gcnt1Q09324 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Gcnt1Q09324 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Gcnt1Q09324 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Gcnt1Q09324 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
Gcnt1Q09324 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Gcnt1Q09324 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Gcnt1Q09324 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
Gcnt1Q09324 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Gcnt1Q09324 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Gcnt1Q09324 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Gcnt1Q09324 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Gcnt1Q09324 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
Gcnt1Q09324 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Gcnt1Q09324 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Gcnt1Q09324 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Gcnt1Q09324 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
Gcnt1Q09324 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Gcnt1Q09324 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Gcnt1Q09324 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
Gcnt1Q09324 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Gcnt1Q09324 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Gcnt1Q09324 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
Gcnt1Q09324 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
Gcnt1Q09324 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Gcnt1Q09324 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
Gcnt1Q09324 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Gcnt1Q09324 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Gcnt1Q09324 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Gcnt1Q09324 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
Gcnt1Q09324 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
Gcnt1Q09324 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC27.7■■■□□ 2.03
Gcnt1Q09324 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Gcnt1Q09324 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
Gcnt1Q09324 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Gcnt1Q09324 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
Gcnt1Q09324 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Gcnt1Q09324 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Gcnt1Q09324 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC27.65■■■□□ 2.02
Gcnt1Q09324 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Gcnt1Q09324 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Gcnt1Q09324 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
Gcnt1Q09324 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
Gcnt1Q09324 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Gcnt1Q09324 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Gcnt1Q09324 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
Gcnt1Q09324 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Gcnt1Q09324 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Gcnt1Q09324 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.61■■■□□ 2.01
Gcnt1Q09324 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Gcnt1Q09324 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
Gcnt1Q09324 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
Gcnt1Q09324 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Gcnt1Q09324 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC27.57■■■□□ 2
Gcnt1Q09324 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC27.57■■■□□ 2
Gcnt1Q09324 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC27.57■■■□□ 2
Gcnt1Q09324 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
Gcnt1Q09324 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Gcnt1Q09324 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
Gcnt1Q09324 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Gcnt1Q09324 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
Gcnt1Q09324 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
Gcnt1Q09324 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Gcnt1Q09324 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Gcnt1Q09324 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
Gcnt1Q09324 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC27.51■■□□□ 1.99
Gcnt1Q09324 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Gcnt1Q09324 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Gcnt1Q09324 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
Gcnt1Q09324 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
Gcnt1Q09324 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
Gcnt1Q09324 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC27.49■■□□□ 1.99
Gcnt1Q09324 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
Gcnt1Q09324 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Gcnt1Q09324 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
Gcnt1Q09324 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
Gcnt1Q09324 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC27.48■■□□□ 1.99
Gcnt1Q09324 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Gcnt1Q09324 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.7 ms