Protein–RNA interactions for Protein: Q08943

Ssrp1, FACT complex subunit SSRP1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 708 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssrp1Q08943 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Ssrp1Q08943 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Ssrp1Q08943 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Ssrp1Q08943 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
Ssrp1Q08943 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Ssrp1Q08943 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Ssrp1Q08943 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Ssrp1Q08943 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
Ssrp1Q08943 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Ssrp1Q08943 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Ssrp1Q08943 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Ssrp1Q08943 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Ssrp1Q08943 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Ssrp1Q08943 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
Ssrp1Q08943 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Ssrp1Q08943 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Ssrp1Q08943 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
Ssrp1Q08943 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
Ssrp1Q08943 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC26.95■■□□□ 1.9
Ssrp1Q08943 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC26.95■■□□□ 1.9
Ssrp1Q08943 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Ssrp1Q08943 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Ssrp1Q08943 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC26.93■■□□□ 1.9
Ssrp1Q08943 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
Ssrp1Q08943 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Ssrp1Q08943 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Ssrp1Q08943 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Ssrp1Q08943 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Ssrp1Q08943 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
Ssrp1Q08943 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
Ssrp1Q08943 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
Ssrp1Q08943 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Ssrp1Q08943 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
Ssrp1Q08943 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Ssrp1Q08943 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
Ssrp1Q08943 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
Ssrp1Q08943 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
Ssrp1Q08943 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Ssrp1Q08943 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
Ssrp1Q08943 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Ssrp1Q08943 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Ssrp1Q08943 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
Ssrp1Q08943 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Ssrp1Q08943 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
Ssrp1Q08943 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Ssrp1Q08943 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
Ssrp1Q08943 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Ssrp1Q08943 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
Ssrp1Q08943 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Ssrp1Q08943 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Ssrp1Q08943 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Ssrp1Q08943 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
Ssrp1Q08943 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Ssrp1Q08943 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Ssrp1Q08943 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
Ssrp1Q08943 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
Ssrp1Q08943 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
Ssrp1Q08943 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Ssrp1Q08943 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Ssrp1Q08943 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC26.76■■□□□ 1.87
Ssrp1Q08943 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Ssrp1Q08943 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
Ssrp1Q08943 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Ssrp1Q08943 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
Ssrp1Q08943 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
Ssrp1Q08943 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Ssrp1Q08943 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Ssrp1Q08943 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Ssrp1Q08943 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Ssrp1Q08943 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
Ssrp1Q08943 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Ssrp1Q08943 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Ssrp1Q08943 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Ssrp1Q08943 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
Ssrp1Q08943 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
Ssrp1Q08943 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Ssrp1Q08943 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Ssrp1Q08943 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Ssrp1Q08943 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
Ssrp1Q08943 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
Ssrp1Q08943 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Ssrp1Q08943 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Ssrp1Q08943 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Ssrp1Q08943 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.61■■□□□ 1.85
Ssrp1Q08943 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Ssrp1Q08943 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Ssrp1Q08943 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Ssrp1Q08943 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Ssrp1Q08943 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Ssrp1Q08943 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
Ssrp1Q08943 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.84
Ssrp1Q08943 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC26.57■■□□□ 1.84
Ssrp1Q08943 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Ssrp1Q08943 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
Ssrp1Q08943 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Ssrp1Q08943 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
Ssrp1Q08943 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Ssrp1Q08943 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Ssrp1Q08943 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Ssrp1Q08943 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 91.6 ms