Protein–RNA interactions for Protein: Q08024

Cbfb, Core-binding factor subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 187 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CbfbQ08024 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CbfbQ08024 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CbfbQ08024 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CbfbQ08024 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CbfbQ08024 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
CbfbQ08024 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
CbfbQ08024 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CbfbQ08024 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CbfbQ08024 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CbfbQ08024 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CbfbQ08024 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CbfbQ08024 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CbfbQ08024 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CbfbQ08024 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CbfbQ08024 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CbfbQ08024 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CbfbQ08024 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CbfbQ08024 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CbfbQ08024 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CbfbQ08024 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CbfbQ08024 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CbfbQ08024 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CbfbQ08024 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CbfbQ08024 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CbfbQ08024 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CbfbQ08024 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CbfbQ08024 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CbfbQ08024 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CbfbQ08024 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CbfbQ08024 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CbfbQ08024 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CbfbQ08024 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CbfbQ08024 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
CbfbQ08024 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CbfbQ08024 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CbfbQ08024 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CbfbQ08024 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CbfbQ08024 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CbfbQ08024 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CbfbQ08024 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CbfbQ08024 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CbfbQ08024 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CbfbQ08024 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CbfbQ08024 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CbfbQ08024 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CbfbQ08024 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CbfbQ08024 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CbfbQ08024 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CbfbQ08024 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
CbfbQ08024 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CbfbQ08024 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CbfbQ08024 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CbfbQ08024 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CbfbQ08024 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CbfbQ08024 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CbfbQ08024 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CbfbQ08024 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CbfbQ08024 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CbfbQ08024 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CbfbQ08024 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CbfbQ08024 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
CbfbQ08024 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CbfbQ08024 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CbfbQ08024 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CbfbQ08024 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CbfbQ08024 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CbfbQ08024 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
CbfbQ08024 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
CbfbQ08024 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CbfbQ08024 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CbfbQ08024 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CbfbQ08024 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CbfbQ08024 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CbfbQ08024 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CbfbQ08024 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CbfbQ08024 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CbfbQ08024 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CbfbQ08024 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CbfbQ08024 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CbfbQ08024 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
CbfbQ08024 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CbfbQ08024 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CbfbQ08024 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CbfbQ08024 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CbfbQ08024 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CbfbQ08024 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CbfbQ08024 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CbfbQ08024 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CbfbQ08024 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CbfbQ08024 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CbfbQ08024 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CbfbQ08024 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CbfbQ08024 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CbfbQ08024 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CbfbQ08024 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CbfbQ08024 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CbfbQ08024 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CbfbQ08024 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CbfbQ08024 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CbfbQ08024 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 7.4 ms