Protein–RNA interactions for Protein: Q07424

Cdx4, Homeobox protein CDX-4, mousemouse

Predictions only

Length 282 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdx4Q07424 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cdx4Q07424 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cdx4Q07424 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cdx4Q07424 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cdx4Q07424 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cdx4Q07424 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cdx4Q07424 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cdx4Q07424 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Cdx4Q07424 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cdx4Q07424 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cdx4Q07424 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cdx4Q07424 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cdx4Q07424 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cdx4Q07424 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cdx4Q07424 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Cdx4Q07424 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Cdx4Q07424 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Cdx4Q07424 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cdx4Q07424 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cdx4Q07424 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cdx4Q07424 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cdx4Q07424 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cdx4Q07424 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cdx4Q07424 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cdx4Q07424 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cdx4Q07424 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cdx4Q07424 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cdx4Q07424 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cdx4Q07424 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cdx4Q07424 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cdx4Q07424 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Cdx4Q07424 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cdx4Q07424 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cdx4Q07424 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cdx4Q07424 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cdx4Q07424 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cdx4Q07424 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cdx4Q07424 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cdx4Q07424 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cdx4Q07424 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cdx4Q07424 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cdx4Q07424 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cdx4Q07424 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Cdx4Q07424 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cdx4Q07424 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cdx4Q07424 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cdx4Q07424 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cdx4Q07424 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cdx4Q07424 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cdx4Q07424 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cdx4Q07424 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cdx4Q07424 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cdx4Q07424 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cdx4Q07424 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cdx4Q07424 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Cdx4Q07424 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cdx4Q07424 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cdx4Q07424 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Cdx4Q07424 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cdx4Q07424 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Cdx4Q07424 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Cdx4Q07424 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Cdx4Q07424 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cdx4Q07424 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Cdx4Q07424 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cdx4Q07424 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cdx4Q07424 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cdx4Q07424 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cdx4Q07424 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Cdx4Q07424 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Cdx4Q07424 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Cdx4Q07424 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Cdx4Q07424 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Cdx4Q07424 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Cdx4Q07424 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Cdx4Q07424 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Cdx4Q07424 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Cdx4Q07424 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Cdx4Q07424 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Cdx4Q07424 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Cdx4Q07424 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Cdx4Q07424 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Cdx4Q07424 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cdx4Q07424 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cdx4Q07424 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Cdx4Q07424 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cdx4Q07424 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cdx4Q07424 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cdx4Q07424 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cdx4Q07424 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cdx4Q07424 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cdx4Q07424 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cdx4Q07424 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cdx4Q07424 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cdx4Q07424 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cdx4Q07424 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cdx4Q07424 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cdx4Q07424 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cdx4Q07424 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cdx4Q07424 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 100.7 ms