Protein–RNA interactions for Protein: Q05920

Pc, Pyruvate carboxylase, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 1,178 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PcQ05920 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
PcQ05920 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
PcQ05920 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC28.67■■■□□ 2.18
PcQ05920 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
PcQ05920 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
PcQ05920 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
PcQ05920 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
PcQ05920 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
PcQ05920 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
PcQ05920 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
PcQ05920 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
PcQ05920 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
PcQ05920 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
PcQ05920 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
PcQ05920 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
PcQ05920 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
PcQ05920 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
PcQ05920 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
PcQ05920 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
PcQ05920 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
PcQ05920 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
PcQ05920 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
PcQ05920 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC28.59■■■□□ 2.17
PcQ05920 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
PcQ05920 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC28.57■■■□□ 2.16
PcQ05920 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
PcQ05920 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
PcQ05920 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
PcQ05920 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
PcQ05920 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
PcQ05920 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
PcQ05920 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
PcQ05920 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
PcQ05920 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
PcQ05920 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
PcQ05920 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
PcQ05920 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
PcQ05920 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
PcQ05920 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
PcQ05920 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
PcQ05920 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
PcQ05920 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
PcQ05920 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
PcQ05920 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
PcQ05920 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
PcQ05920 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
PcQ05920 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
PcQ05920 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
PcQ05920 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
PcQ05920 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
PcQ05920 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
PcQ05920 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
PcQ05920 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
PcQ05920 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
PcQ05920 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
PcQ05920 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC28.41■■■□□ 2.14
PcQ05920 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
PcQ05920 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.13
PcQ05920 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
PcQ05920 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
PcQ05920 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
PcQ05920 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
PcQ05920 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.36■■■□□ 2.13
PcQ05920 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
PcQ05920 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
PcQ05920 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
PcQ05920 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC28.34■■■□□ 2.13
PcQ05920 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
PcQ05920 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
PcQ05920 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC28.33■■■□□ 2.13
PcQ05920 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
PcQ05920 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
PcQ05920 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC28.3■■■□□ 2.12
PcQ05920 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
PcQ05920 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
PcQ05920 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
PcQ05920 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
PcQ05920 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
PcQ05920 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
PcQ05920 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
PcQ05920 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
PcQ05920 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
PcQ05920 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
PcQ05920 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
PcQ05920 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
PcQ05920 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC28.21■■■□□ 2.11
PcQ05920 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC28.21■■■□□ 2.11
PcQ05920 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
PcQ05920 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
PcQ05920 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
PcQ05920 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
PcQ05920 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
PcQ05920 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
PcQ05920 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
PcQ05920 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
PcQ05920 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
PcQ05920 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC28.18■■■□□ 2.1
PcQ05920 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
PcQ05920 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
PcQ05920 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.6 ms