Protein–RNA interactions for Protein: Q05915

Gch1, GTP cyclohydrolase 1, mousemouse

Predictions only

Length 241 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gch1Q05915 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Gch1Q05915 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Gch1Q05915 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Gch1Q05915 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Gch1Q05915 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Gch1Q05915 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Gch1Q05915 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Gch1Q05915 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Gch1Q05915 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Gch1Q05915 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Gch1Q05915 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Gch1Q05915 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Gch1Q05915 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Gch1Q05915 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Gch1Q05915 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Gch1Q05915 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Gch1Q05915 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Gch1Q05915 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Gch1Q05915 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Gch1Q05915 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Gch1Q05915 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Gch1Q05915 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Gch1Q05915 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Gch1Q05915 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Gch1Q05915 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Gch1Q05915 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Gch1Q05915 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Gch1Q05915 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Gch1Q05915 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Gch1Q05915 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Gch1Q05915 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Gch1Q05915 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Gch1Q05915 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Gch1Q05915 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Gch1Q05915 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Gch1Q05915 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Gch1Q05915 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Gch1Q05915 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Gch1Q05915 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Gch1Q05915 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Gch1Q05915 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Gch1Q05915 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Gch1Q05915 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Gch1Q05915 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Gch1Q05915 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Gch1Q05915 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Gch1Q05915 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Gch1Q05915 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Gch1Q05915 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Gch1Q05915 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Gch1Q05915 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Gch1Q05915 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Gch1Q05915 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Gch1Q05915 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Gch1Q05915 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Gch1Q05915 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Gch1Q05915 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Gch1Q05915 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Gch1Q05915 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Gch1Q05915 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Gch1Q05915 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Gch1Q05915 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Gch1Q05915 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Gch1Q05915 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Gch1Q05915 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Gch1Q05915 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Gch1Q05915 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Gch1Q05915 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Gch1Q05915 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Gch1Q05915 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Gch1Q05915 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Gch1Q05915 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Gch1Q05915 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Gch1Q05915 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Gch1Q05915 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Gch1Q05915 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Gch1Q05915 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Gch1Q05915 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Gch1Q05915 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Gch1Q05915 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Gch1Q05915 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Gch1Q05915 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Gch1Q05915 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Gch1Q05915 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Gch1Q05915 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Gch1Q05915 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Gch1Q05915 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Gch1Q05915 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Gch1Q05915 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Gch1Q05915 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Gch1Q05915 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Gch1Q05915 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Gch1Q05915 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Gch1Q05915 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Gch1Q05915 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Gch1Q05915 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Gch1Q05915 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Gch1Q05915 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Gch1Q05915 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Gch1Q05915 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.9 ms