Protein–RNA interactions for Protein: Q05793

Hspg2, Basement membrane-specific heparan sulfate proteoglycan core protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 3,707 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hspg2Q05793 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Hspg2Q05793 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Hspg2Q05793 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Hspg2Q05793 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Hspg2Q05793 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Hspg2Q05793 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Hspg2Q05793 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Hspg2Q05793 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Hspg2Q05793 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Hspg2Q05793 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Hspg2Q05793 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Hspg2Q05793 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Hspg2Q05793 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Hspg2Q05793 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Hspg2Q05793 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Hspg2Q05793 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Hspg2Q05793 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Hspg2Q05793 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Hspg2Q05793 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Hspg2Q05793 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Hspg2Q05793 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Hspg2Q05793 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Hspg2Q05793 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Hspg2Q05793 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Hspg2Q05793 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Hspg2Q05793 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Hspg2Q05793 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Hspg2Q05793 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Hspg2Q05793 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Hspg2Q05793 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Hspg2Q05793 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Hspg2Q05793 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Hspg2Q05793 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Hspg2Q05793 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Hspg2Q05793 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Hspg2Q05793 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Hspg2Q05793 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Hspg2Q05793 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Hspg2Q05793 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Hspg2Q05793 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Hspg2Q05793 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Hspg2Q05793 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Hspg2Q05793 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Hspg2Q05793 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Hspg2Q05793 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Hspg2Q05793 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Hspg2Q05793 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Hspg2Q05793 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Hspg2Q05793 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Hspg2Q05793 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Hspg2Q05793 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Hspg2Q05793 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Hspg2Q05793 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Hspg2Q05793 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Hspg2Q05793 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Hspg2Q05793 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Hspg2Q05793 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Hspg2Q05793 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Hspg2Q05793 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Hspg2Q05793 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Hspg2Q05793 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Hspg2Q05793 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Hspg2Q05793 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Hspg2Q05793 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Hspg2Q05793 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Hspg2Q05793 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Hspg2Q05793 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Hspg2Q05793 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Hspg2Q05793 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Hspg2Q05793 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Hspg2Q05793 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Hspg2Q05793 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Hspg2Q05793 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Hspg2Q05793 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Hspg2Q05793 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Hspg2Q05793 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Hspg2Q05793 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Hspg2Q05793 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Hspg2Q05793 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Hspg2Q05793 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Hspg2Q05793 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Hspg2Q05793 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Hspg2Q05793 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Hspg2Q05793 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Hspg2Q05793 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Hspg2Q05793 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Hspg2Q05793 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Hspg2Q05793 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Hspg2Q05793 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Hspg2Q05793 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Hspg2Q05793 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Hspg2Q05793 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Hspg2Q05793 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Hspg2Q05793 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Hspg2Q05793 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Hspg2Q05793 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Hspg2Q05793 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Hspg2Q05793 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Hspg2Q05793 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Hspg2Q05793 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.5 ms