Protein–RNA interactions for Protein: Q04201

CUE4, CUE domain-containing protein CUE4, yeastyeast

Predicted RBP Predictions only

Length 117 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
CUE4Q04201 tL(GAG)GtL(GAG)G 82 nt7.1□□□□□ -1.27
CUE4Q04201 EMC3YKL207W 762 nt7.1□□□□□ -1.27
CUE4Q04201 MDH2YOL126C 1134 nt7.1□□□□□ -1.27
CUE4Q04201 FRT1YOR324C 1809 nt7.1□□□□□ -1.27
CUE4Q04201 OSH7YHR001W 1314 nt7.09□□□□□ -1.27
CUE4Q04201 SLM3YDL033C 1254 nt7.09□□□□□ -1.27
CUE4Q04201 FTH1YBR207W 1398 nt7.08□□□□□ -1.28
CUE4Q04201 DIA4YHR011W 1341 nt7.08□□□□□ -1.28
CUE4Q04201 CHA1YCL064C 1083 nt7.08□□□□□ -1.28
CUE4Q04201 YER188WYER188W 720 nt7.08□□□□□ -1.28
CUE4Q04201 VPS75YNL246W 795 nt7.08□□□□□ -1.28
CUE4Q04201 GGC1YDL198C 903 nt7.07□□□□□ -1.28
CUE4Q04201 MET28YIR017C 564 nt7.07□□□□□ -1.28
CUE4Q04201 ITR1YDR497C 1755 nt7.07□□□□□ -1.28
CUE4Q04201 TAT2YOL020W 1779 nt7.06□□□□□ -1.28
CUE4Q04201 RTG2YGL252C 1767 nt7.05□□□□□ -1.28
CUE4Q04201 MRPL8YJL063C 717 nt7.05□□□□□ -1.28
CUE4Q04201 TOP3YLR234W 1971 nt7.04□□□□□ -1.28
CUE4Q04201 PRC1YMR297W 1599 nt7.04□□□□□ -1.28
CUE4Q04201 ATP10YLR393W 840 nt7.04□□□□□ -1.28
CUE4Q04201 YMR210WYMR210W 1350 nt7.04□□□□□ -1.28
CUE4Q04201 PMA2YPL036W 2844 nt7.04□□□□□ -1.28
CUE4Q04201 CTF3YLR381W 2202 nt7.03□□□□□ -1.28
CUE4Q04201 FUB1YCR076C 753 nt7.03□□□□□ -1.28
CUE4Q04201 ASP3-1YLR155C 1089 nt7.03□□□□□ -1.28
CUE4Q04201 ASP3-2YLR157C 1089 nt7.03□□□□□ -1.28
CUE4Q04201 ASP3-3YLR158C 1089 nt7.03□□□□□ -1.28
CUE4Q04201 ASP3-4YLR160C 1089 nt7.03□□□□□ -1.28
CUE4Q04201 NAT4YMR069W 858 nt7.02□□□□□ -1.29
CUE4Q04201 AAT1YKL106W 1356 nt7.01□□□□□ -1.29
CUE4Q04201 BNI5YNL166C 1347 nt7.01□□□□□ -1.29
CUE4Q04201 NDE1YMR145C 1683 nt7□□□□□ -1.29
CUE4Q04201 GND1YHR183W 1470 nt7□□□□□ -1.29
CUE4Q04201 SPE4YLR146C 903 nt7□□□□□ -1.29
CUE4Q04201 BEM1YBR200W 1656 nt7□□□□□ -1.29
CUE4Q04201 ERG6YML008C 1152 nt6.99□□□□□ -1.29
CUE4Q04201 YBL095WYBL095W 813 nt6.99□□□□□ -1.29
CUE4Q04201 GPN2YOR262W 1044 nt6.99□□□□□ -1.29
CUE4Q04201 MSC1YML128C 1542 nt6.98□□□□□ -1.29
CUE4Q04201 YDR010CYDR010C 333 nt6.98□□□□□ -1.29
CUE4Q04201 PMT7YDR307W 1989 nt6.98□□□□□ -1.29
CUE4Q04201 SOL2YCR073W-A 948 nt6.97□□□□□ -1.29
CUE4Q04201 PAU7YAR020C 168 nt6.97□□□□□ -1.29
CUE4Q04201 RTG1YOL067C 534 nt6.97□□□□□ -1.29
CUE4Q04201 FIT3YOR383C 615 nt6.97□□□□□ -1.29
CUE4Q04201 PEX25YPL112C 1185 nt6.97□□□□□ -1.29
CUE4Q04201 YPL264CYPL264C 1062 nt6.97□□□□□ -1.29
CUE4Q04201 ECM10YEL030W 1935 nt6.97□□□□□ -1.29
CUE4Q04201 GCD11YER025W 1584 nt6.96□□□□□ -1.29
CUE4Q04201 YIL177CYIL177C 5277 nt6.95□□□□□ -1.3
CUE4Q04201 YLR173WYLR173W 1827 nt6.95□□□□□ -1.3
CUE4Q04201 ERR3YMR323W 1314 nt6.95□□□□□ -1.3
CUE4Q04201 ERR1YOR393W 1314 nt6.95□□□□□ -1.3
CUE4Q04201 ERR2YPL281C 1314 nt6.95□□□□□ -1.3
CUE4Q04201 ADE5,7YGL234W 2409 nt6.95□□□□□ -1.3
CUE4Q04201 YMR253CYMR253C 1245 nt6.94□□□□□ -1.3
CUE4Q04201 YMC2YBR104W 990 nt6.94□□□□□ -1.3
CUE4Q04201 YMR265CYMR265C 1386 nt6.94□□□□□ -1.3
CUE4Q04201 GPM1YKL152C 744 nt6.93□□□□□ -1.3
CUE4Q04201 YLR072WYLR072W 2082 nt6.92□□□□□ -1.3
CUE4Q04201 YDR455CYDR455C 309 nt6.92□□□□□ -1.3
CUE4Q04201 YFL066CYFL066C 1179 nt6.92□□□□□ -1.3
CUE4Q04201 LEA1YPL213W 717 nt6.92□□□□□ -1.3
CUE4Q04201 LOT5YKL183W 921 nt6.91□□□□□ -1.3
CUE4Q04201 RAS2YNL098C 969 nt6.9□□□□□ -1.3
CUE4Q04201 ATO2YNR002C 849 nt6.89□□□□□ -1.31
CUE4Q04201 YIL108WYIL108W 2091 nt6.89□□□□□ -1.31
CUE4Q04201 RPN14YGL004C 1254 nt6.88□□□□□ -1.31
CUE4Q04201 SAC7YDR389W 1965 nt6.88□□□□□ -1.31
CUE4Q04201 YEL034C-AYEL034C-A 603 nt6.87□□□□□ -1.31
CUE4Q04201 HAP5YOR358W 729 nt6.87□□□□□ -1.31
CUE4Q04201 ERG13YML126C 1476 nt6.86□□□□□ -1.31
CUE4Q04201 YNL040WYNL040W 1371 nt6.86□□□□□ -1.31
CUE4Q04201 YER152CYER152C 1332 nt6.86□□□□□ -1.31
CUE4Q04201 ELO1YJL196C 933 nt6.86□□□□□ -1.31
CUE4Q04201 AQR1YNL065W 1761 nt6.86□□□□□ -1.31
CUE4Q04201 HXT9YJL219W 1704 nt6.86□□□□□ -1.31
CUE4Q04201 MAS2YHR024C 1449 nt6.84□□□□□ -1.31
CUE4Q04201 PHO89YBR296C 1725 nt6.84□□□□□ -1.31
CUE4Q04201 AFG2YLR397C 2343 nt6.84□□□□□ -1.31
CUE4Q04201 SAM50YNL026W 1455 nt6.84□□□□□ -1.31
CUE4Q04201 COQ2YNR041C 1119 nt6.83□□□□□ -1.32
CUE4Q04201 POB3YML069W 1659 nt6.82□□□□□ -1.32
CUE4Q04201 SUV3YPL029W 2214 nt6.81□□□□□ -1.32
CUE4Q04201 HXT13YEL069C 1695 nt6.81□□□□□ -1.32
CUE4Q04201 RRT6YGL146C 936 nt6.81□□□□□ -1.32
CUE4Q04201 NUC1YJL208C 990 nt6.81□□□□□ -1.32
CUE4Q04201 YFL015W-AYFL015W-A 318 nt6.8□□□□□ -1.32
CUE4Q04201 CLB6YGR109C 1143 nt6.8□□□□□ -1.32
CUE4Q04201 MRS4YKR052C 915 nt6.8□□□□□ -1.32
CUE4Q04201 ABP1YCR088W 1779 nt6.8□□□□□ -1.32
CUE4Q04201 YFR018CYFR018C 1092 nt6.79□□□□□ -1.32
CUE4Q04201 XYL2YLR070C 1071 nt6.79□□□□□ -1.32
CUE4Q04201 RSC4YKR008W 1878 nt6.79□□□□□ -1.32
CUE4Q04201 THI3YDL080C 1830 nt6.78□□□□□ -1.32
CUE4Q04201 WSC4YHL028W 1818 nt6.78□□□□□ -1.32
CUE4Q04201 CCR4YAL021C 2514 nt6.78□□□□□ -1.32
CUE4Q04201 ESS1YJR017C 513 nt6.78□□□□□ -1.32
CUE4Q04201 snR86snR86 1004 nt6.77□□□□□ -1.33
CUE4Q04201 YRF1-3YGR296W 5580 nt6.77□□□□□ -1.33
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 12.3 ms