Protein–RNA interactions for Protein: Q03958

Pfdn6, Prefoldin subunit 6, mousemouse

Predictions only

Length 127 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pfdn6Q03958 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Pfdn6Q03958 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
Pfdn6Q03958 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Pfdn6Q03958 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Pfdn6Q03958 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
Pfdn6Q03958 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Pfdn6Q03958 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Pfdn6Q03958 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Pfdn6Q03958 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
Pfdn6Q03958 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Pfdn6Q03958 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Pfdn6Q03958 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Pfdn6Q03958 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Pfdn6Q03958 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Pfdn6Q03958 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Pfdn6Q03958 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Pfdn6Q03958 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Pfdn6Q03958 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Pfdn6Q03958 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Pfdn6Q03958 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Pfdn6Q03958 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Pfdn6Q03958 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Pfdn6Q03958 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Pfdn6Q03958 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Pfdn6Q03958 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Pfdn6Q03958 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
Pfdn6Q03958 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Pfdn6Q03958 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Pfdn6Q03958 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
Pfdn6Q03958 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Pfdn6Q03958 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Pfdn6Q03958 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Pfdn6Q03958 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Pfdn6Q03958 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Pfdn6Q03958 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Pfdn6Q03958 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Pfdn6Q03958 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Pfdn6Q03958 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Pfdn6Q03958 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Pfdn6Q03958 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
Pfdn6Q03958 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Pfdn6Q03958 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Pfdn6Q03958 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Pfdn6Q03958 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Pfdn6Q03958 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Pfdn6Q03958 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Pfdn6Q03958 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Pfdn6Q03958 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Pfdn6Q03958 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
Pfdn6Q03958 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Pfdn6Q03958 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Pfdn6Q03958 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Pfdn6Q03958 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Pfdn6Q03958 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Pfdn6Q03958 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Pfdn6Q03958 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Pfdn6Q03958 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Pfdn6Q03958 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Pfdn6Q03958 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Pfdn6Q03958 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Pfdn6Q03958 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Pfdn6Q03958 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Pfdn6Q03958 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Pfdn6Q03958 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Pfdn6Q03958 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Pfdn6Q03958 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Pfdn6Q03958 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Pfdn6Q03958 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Pfdn6Q03958 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Pfdn6Q03958 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Pfdn6Q03958 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Pfdn6Q03958 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Pfdn6Q03958 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Pfdn6Q03958 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Pfdn6Q03958 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Pfdn6Q03958 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Pfdn6Q03958 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Pfdn6Q03958 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Pfdn6Q03958 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Pfdn6Q03958 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Pfdn6Q03958 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Pfdn6Q03958 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC23.95■■□□□ 1.43
Pfdn6Q03958 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Pfdn6Q03958 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Pfdn6Q03958 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Pfdn6Q03958 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
Pfdn6Q03958 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
Pfdn6Q03958 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Pfdn6Q03958 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Pfdn6Q03958 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Pfdn6Q03958 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
Pfdn6Q03958 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Pfdn6Q03958 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Pfdn6Q03958 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Pfdn6Q03958 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Pfdn6Q03958 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Pfdn6Q03958 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Pfdn6Q03958 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Pfdn6Q03958 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Pfdn6Q03958 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.2 ms