Protein–RNA interactions for Protein: Q03404

Tff2, Trefoil factor 2, mousemouse

Predictions only

Length 129 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tff2Q03404 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
Tff2Q03404 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
Tff2Q03404 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
Tff2Q03404 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Tff2Q03404 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
Tff2Q03404 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Tff2Q03404 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Tff2Q03404 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Tff2Q03404 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Tff2Q03404 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Tff2Q03404 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Tff2Q03404 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Tff2Q03404 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
Tff2Q03404 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.48■■□□□ 1.99
Tff2Q03404 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC27.47■■□□□ 1.99
Tff2Q03404 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Tff2Q03404 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC27.46■■□□□ 1.99
Tff2Q03404 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Tff2Q03404 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
Tff2Q03404 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Tff2Q03404 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Tff2Q03404 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Tff2Q03404 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
Tff2Q03404 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
Tff2Q03404 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
Tff2Q03404 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
Tff2Q03404 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Tff2Q03404 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC27.4■■□□□ 1.98
Tff2Q03404 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Tff2Q03404 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
Tff2Q03404 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Tff2Q03404 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
Tff2Q03404 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Tff2Q03404 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Tff2Q03404 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC27.37■■□□□ 1.97
Tff2Q03404 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Tff2Q03404 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
Tff2Q03404 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
Tff2Q03404 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Tff2Q03404 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Tff2Q03404 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
Tff2Q03404 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Tff2Q03404 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
Tff2Q03404 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Tff2Q03404 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
Tff2Q03404 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Tff2Q03404 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Tff2Q03404 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
Tff2Q03404 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Tff2Q03404 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Tff2Q03404 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Tff2Q03404 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Tff2Q03404 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Tff2Q03404 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
Tff2Q03404 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC27.27■■□□□ 1.96
Tff2Q03404 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Tff2Q03404 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Tff2Q03404 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Tff2Q03404 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
Tff2Q03404 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC27.26■■□□□ 1.95
Tff2Q03404 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Tff2Q03404 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Tff2Q03404 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Tff2Q03404 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Tff2Q03404 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
Tff2Q03404 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Tff2Q03404 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
Tff2Q03404 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Tff2Q03404 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Tff2Q03404 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC27.2■■□□□ 1.94
Tff2Q03404 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Tff2Q03404 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Tff2Q03404 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
Tff2Q03404 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Tff2Q03404 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Tff2Q03404 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Tff2Q03404 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Tff2Q03404 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Tff2Q03404 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Tff2Q03404 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Tff2Q03404 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
Tff2Q03404 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
Tff2Q03404 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Tff2Q03404 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Tff2Q03404 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
Tff2Q03404 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
Tff2Q03404 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
Tff2Q03404 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Tff2Q03404 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC27.11■■□□□ 1.93
Tff2Q03404 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
Tff2Q03404 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Tff2Q03404 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Tff2Q03404 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
Tff2Q03404 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Tff2Q03404 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
Tff2Q03404 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
Tff2Q03404 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
Tff2Q03404 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
Tff2Q03404 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.92
Tff2Q03404 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.1 ms