Protein–RNA interactions for Protein: Q03347

Runx1, Runt-related transcription factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 451 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Runx1Q03347 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Runx1Q03347 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Runx1Q03347 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Runx1Q03347 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Runx1Q03347 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Runx1Q03347 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Runx1Q03347 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Runx1Q03347 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Runx1Q03347 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Runx1Q03347 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Runx1Q03347 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Runx1Q03347 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Runx1Q03347 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Runx1Q03347 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Runx1Q03347 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Runx1Q03347 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Runx1Q03347 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Runx1Q03347 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Runx1Q03347 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Runx1Q03347 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Runx1Q03347 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Runx1Q03347 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Runx1Q03347 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Runx1Q03347 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Runx1Q03347 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Runx1Q03347 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Runx1Q03347 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Runx1Q03347 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Runx1Q03347 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Runx1Q03347 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Runx1Q03347 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Runx1Q03347 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Runx1Q03347 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Runx1Q03347 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Runx1Q03347 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Runx1Q03347 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Runx1Q03347 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Runx1Q03347 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Runx1Q03347 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Runx1Q03347 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Runx1Q03347 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Runx1Q03347 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Runx1Q03347 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Runx1Q03347 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Runx1Q03347 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Runx1Q03347 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Runx1Q03347 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Runx1Q03347 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Runx1Q03347 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Runx1Q03347 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Runx1Q03347 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Runx1Q03347 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Runx1Q03347 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Runx1Q03347 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Runx1Q03347 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Runx1Q03347 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Runx1Q03347 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Runx1Q03347 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Runx1Q03347 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Runx1Q03347 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Runx1Q03347 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Runx1Q03347 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Runx1Q03347 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Runx1Q03347 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Runx1Q03347 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Runx1Q03347 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Runx1Q03347 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Runx1Q03347 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Runx1Q03347 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Runx1Q03347 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Runx1Q03347 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Runx1Q03347 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Runx1Q03347 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Runx1Q03347 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Runx1Q03347 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Runx1Q03347 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Runx1Q03347 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Runx1Q03347 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Runx1Q03347 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Runx1Q03347 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Runx1Q03347 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Runx1Q03347 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Runx1Q03347 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Runx1Q03347 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Runx1Q03347 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Runx1Q03347 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Runx1Q03347 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Runx1Q03347 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Runx1Q03347 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Runx1Q03347 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Runx1Q03347 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Runx1Q03347 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Runx1Q03347 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Runx1Q03347 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Runx1Q03347 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Runx1Q03347 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Runx1Q03347 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Runx1Q03347 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Runx1Q03347 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Runx1Q03347 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.1 ms