Protein–RNA interactions for Protein: Q03147

Cdk7, Cyclin-dependent kinase 7, mousemouse

Predictions only

Length 346 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdk7Q03147 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Cdk7Q03147 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Cdk7Q03147 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Cdk7Q03147 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Cdk7Q03147 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Cdk7Q03147 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
Cdk7Q03147 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Cdk7Q03147 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Cdk7Q03147 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Cdk7Q03147 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Cdk7Q03147 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
Cdk7Q03147 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Cdk7Q03147 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Cdk7Q03147 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Cdk7Q03147 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Cdk7Q03147 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Cdk7Q03147 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Cdk7Q03147 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Cdk7Q03147 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Cdk7Q03147 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
Cdk7Q03147 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Cdk7Q03147 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Cdk7Q03147 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Cdk7Q03147 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Cdk7Q03147 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
Cdk7Q03147 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Cdk7Q03147 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Cdk7Q03147 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Cdk7Q03147 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Cdk7Q03147 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Cdk7Q03147 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Cdk7Q03147 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Cdk7Q03147 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Cdk7Q03147 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Cdk7Q03147 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Cdk7Q03147 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Cdk7Q03147 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Cdk7Q03147 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Cdk7Q03147 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Cdk7Q03147 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Cdk7Q03147 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Cdk7Q03147 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Cdk7Q03147 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Cdk7Q03147 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Cdk7Q03147 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Cdk7Q03147 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Cdk7Q03147 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Cdk7Q03147 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Cdk7Q03147 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Cdk7Q03147 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Cdk7Q03147 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Cdk7Q03147 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Cdk7Q03147 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
Cdk7Q03147 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Cdk7Q03147 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Cdk7Q03147 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC25■■□□□ 1.59
Cdk7Q03147 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC25■■□□□ 1.59
Cdk7Q03147 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Cdk7Q03147 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Cdk7Q03147 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Cdk7Q03147 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Cdk7Q03147 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Cdk7Q03147 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Cdk7Q03147 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
Cdk7Q03147 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Cdk7Q03147 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Cdk7Q03147 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Cdk7Q03147 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Cdk7Q03147 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Cdk7Q03147 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Cdk7Q03147 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Cdk7Q03147 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Cdk7Q03147 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Cdk7Q03147 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Cdk7Q03147 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Cdk7Q03147 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Cdk7Q03147 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Cdk7Q03147 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Cdk7Q03147 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Cdk7Q03147 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Cdk7Q03147 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Cdk7Q03147 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Cdk7Q03147 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
Cdk7Q03147 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Cdk7Q03147 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Cdk7Q03147 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Cdk7Q03147 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Cdk7Q03147 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Cdk7Q03147 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Cdk7Q03147 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Cdk7Q03147 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Cdk7Q03147 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Cdk7Q03147 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Cdk7Q03147 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Cdk7Q03147 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Cdk7Q03147 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Cdk7Q03147 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
Cdk7Q03147 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Cdk7Q03147 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Cdk7Q03147 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 98.9 ms