Protein–RNA interactions for Protein: Q02738

Gjb4, Gap junction beta-4 protein, mousemouse

Predictions only

Length 266 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gjb4Q02738 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Gjb4Q02738 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Gjb4Q02738 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
Gjb4Q02738 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
Gjb4Q02738 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Gjb4Q02738 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Gjb4Q02738 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Gjb4Q02738 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Gjb4Q02738 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Gjb4Q02738 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
Gjb4Q02738 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
Gjb4Q02738 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Gjb4Q02738 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
Gjb4Q02738 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
Gjb4Q02738 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Gjb4Q02738 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
Gjb4Q02738 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Gjb4Q02738 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Gjb4Q02738 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
Gjb4Q02738 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
Gjb4Q02738 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Gjb4Q02738 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Gjb4Q02738 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
Gjb4Q02738 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Gjb4Q02738 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Gjb4Q02738 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC27.76■■■□□ 2.03
Gjb4Q02738 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
Gjb4Q02738 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Gjb4Q02738 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Gjb4Q02738 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
Gjb4Q02738 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Gjb4Q02738 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Gjb4Q02738 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Gjb4Q02738 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Gjb4Q02738 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Gjb4Q02738 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
Gjb4Q02738 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
Gjb4Q02738 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Gjb4Q02738 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Gjb4Q02738 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Gjb4Q02738 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
Gjb4Q02738 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Gjb4Q02738 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Gjb4Q02738 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
Gjb4Q02738 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Gjb4Q02738 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Gjb4Q02738 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC27.63■■■□□ 2.01
Gjb4Q02738 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Gjb4Q02738 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Gjb4Q02738 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Gjb4Q02738 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Gjb4Q02738 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Gjb4Q02738 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
Gjb4Q02738 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
Gjb4Q02738 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
Gjb4Q02738 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Gjb4Q02738 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Gjb4Q02738 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
Gjb4Q02738 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
Gjb4Q02738 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Gjb4Q02738 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Gjb4Q02738 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Gjb4Q02738 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Gjb4Q02738 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Gjb4Q02738 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Gjb4Q02738 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Gjb4Q02738 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Gjb4Q02738 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Gjb4Q02738 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
Gjb4Q02738 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
Gjb4Q02738 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Gjb4Q02738 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
Gjb4Q02738 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Gjb4Q02738 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Gjb4Q02738 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Gjb4Q02738 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Gjb4Q02738 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
Gjb4Q02738 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Gjb4Q02738 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Gjb4Q02738 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
Gjb4Q02738 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Gjb4Q02738 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Gjb4Q02738 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Gjb4Q02738 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Gjb4Q02738 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Gjb4Q02738 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Gjb4Q02738 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
Gjb4Q02738 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Gjb4Q02738 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Gjb4Q02738 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
Gjb4Q02738 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Gjb4Q02738 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Gjb4Q02738 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
Gjb4Q02738 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Gjb4Q02738 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
Gjb4Q02738 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Gjb4Q02738 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Gjb4Q02738 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Gjb4Q02738 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
Gjb4Q02738 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.7 ms