Protein–RNA interactions for Protein: Q01853

Vcp, Transitional endoplasmic reticulum ATPase, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 806 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VcpQ01853 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
VcpQ01853 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
VcpQ01853 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
VcpQ01853 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
VcpQ01853 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
VcpQ01853 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
VcpQ01853 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
VcpQ01853 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
VcpQ01853 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
VcpQ01853 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
VcpQ01853 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
VcpQ01853 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
VcpQ01853 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
VcpQ01853 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
VcpQ01853 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
VcpQ01853 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
VcpQ01853 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
VcpQ01853 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
VcpQ01853 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
VcpQ01853 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
VcpQ01853 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
VcpQ01853 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
VcpQ01853 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
VcpQ01853 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
VcpQ01853 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
VcpQ01853 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
VcpQ01853 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
VcpQ01853 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
VcpQ01853 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.7
VcpQ01853 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
VcpQ01853 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
VcpQ01853 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
VcpQ01853 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
VcpQ01853 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
VcpQ01853 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
VcpQ01853 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
VcpQ01853 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
VcpQ01853 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
VcpQ01853 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
VcpQ01853 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
VcpQ01853 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
VcpQ01853 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
VcpQ01853 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
VcpQ01853 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
VcpQ01853 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
VcpQ01853 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
VcpQ01853 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
VcpQ01853 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
VcpQ01853 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
VcpQ01853 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
VcpQ01853 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
VcpQ01853 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
VcpQ01853 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
VcpQ01853 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
VcpQ01853 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
VcpQ01853 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
VcpQ01853 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
VcpQ01853 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
VcpQ01853 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
VcpQ01853 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
VcpQ01853 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
VcpQ01853 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
VcpQ01853 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
VcpQ01853 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
VcpQ01853 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
VcpQ01853 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
VcpQ01853 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.68
VcpQ01853 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
VcpQ01853 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
VcpQ01853 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
VcpQ01853 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
VcpQ01853 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
VcpQ01853 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
VcpQ01853 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC25.56■■□□□ 1.68
VcpQ01853 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
VcpQ01853 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
VcpQ01853 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
VcpQ01853 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
VcpQ01853 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
VcpQ01853 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
VcpQ01853 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
VcpQ01853 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
VcpQ01853 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
VcpQ01853 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
VcpQ01853 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
VcpQ01853 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
VcpQ01853 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
VcpQ01853 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
VcpQ01853 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
VcpQ01853 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
VcpQ01853 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
VcpQ01853 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
VcpQ01853 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
VcpQ01853 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
VcpQ01853 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
VcpQ01853 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
VcpQ01853 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
VcpQ01853 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
VcpQ01853 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
VcpQ01853 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.6 ms