Protein–RNA interactions for Protein: Q01320

Top2a, DNA topoisomerase 2-alpha, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,528 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Top2aQ01320 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC40.74■■■■■ 4.11
Top2aQ01320 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC40.73■■■■■ 4.11
Top2aQ01320 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.72■■■■■ 4.11
Top2aQ01320 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC40.7■■■■■ 4.11
Top2aQ01320 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.69■■■■■ 4.1
Top2aQ01320 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.67■■■■■ 4.1
Top2aQ01320 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.67■■■■■ 4.1
Top2aQ01320 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC40.67■■■■■ 4.1
Top2aQ01320 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC40.66■■■■■ 4.1
Top2aQ01320 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC40.65■■■■■ 4.1
Top2aQ01320 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC40.64■■■■■ 4.1
Top2aQ01320 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC40.63■■■■■ 4.1
Top2aQ01320 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.63■■■■■ 4.09
Top2aQ01320 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC40.62■■■■■ 4.09
Top2aQ01320 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC40.62■■■■■ 4.09
Top2aQ01320 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC40.62■■■■■ 4.09
Top2aQ01320 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC40.61■■■■■ 4.09
Top2aQ01320 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.6■■■■■ 4.09
Top2aQ01320 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC40.6■■■■■ 4.09
Top2aQ01320 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC40.59■■■■■ 4.09
Top2aQ01320 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.59■■■■■ 4.09
Top2aQ01320 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC40.58■■■■■ 4.09
Top2aQ01320 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC40.56■■■■■ 4.08
Top2aQ01320 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.55■■■■■ 4.08
Top2aQ01320 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.54■■■■■ 4.08
Top2aQ01320 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.53■■■■■ 4.08
Top2aQ01320 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC40.52■■■■■ 4.08
Top2aQ01320 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC40.52■■■■■ 4.08
Top2aQ01320 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC40.52■■■■■ 4.08
Top2aQ01320 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC40.52■■■■■ 4.08
Top2aQ01320 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC40.51■■■■■ 4.08
Top2aQ01320 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.51■■■■■ 4.08
Top2aQ01320 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC40.5■■■■■ 4.07
Top2aQ01320 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.48■■■■■ 4.07
Top2aQ01320 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC40.46■■■■■ 4.07
Top2aQ01320 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC40.45■■■■■ 4.07
Top2aQ01320 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC40.45■■■■■ 4.07
Top2aQ01320 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC40.44■■■■■ 4.06
Top2aQ01320 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC40.43■■■■■ 4.06
Top2aQ01320 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC40.42■■■■■ 4.06
Top2aQ01320 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC40.42■■■■■ 4.06
Top2aQ01320 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC40.41■■■■■ 4.06
Top2aQ01320 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC40.4■■■■■ 4.06
Top2aQ01320 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC40.37■■■■■ 4.05
Top2aQ01320 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.36■■■■■ 4.05
Top2aQ01320 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC40.36■■■■■ 4.05
Top2aQ01320 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC40.36■■■■■ 4.05
Top2aQ01320 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC40.35■■■■■ 4.05
Top2aQ01320 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC40.34■■■■■ 4.05
Top2aQ01320 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC40.34■■■■■ 4.05
Top2aQ01320 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC40.32■■■■■ 4.05
Top2aQ01320 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.32■■■■■ 4.05
Top2aQ01320 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC40.31■■■■■ 4.04
Top2aQ01320 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC40.31■■■■■ 4.04
Top2aQ01320 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC40.31■■■■■ 4.04
Top2aQ01320 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC40.3■■■■■ 4.04
Top2aQ01320 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC40.3■■■■■ 4.04
Top2aQ01320 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.3■■■■■ 4.04
Top2aQ01320 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC40.29■■■■■ 4.04
Top2aQ01320 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC40.28■■■■■ 4.04
Top2aQ01320 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC40.27■■■■■ 4.04
Top2aQ01320 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC40.26■■■■■ 4.04
Top2aQ01320 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC40.26■■■■■ 4.03
Top2aQ01320 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC40.25■■■■■ 4.03
Top2aQ01320 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC40.25■■■■■ 4.03
Top2aQ01320 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC40.24■■■■■ 4.03
Top2aQ01320 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.24■■■■■ 4.03
Top2aQ01320 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC40.23■■■■■ 4.03
Top2aQ01320 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC40.22■■■■■ 4.03
Top2aQ01320 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC40.22■■■■■ 4.03
Top2aQ01320 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.21■■■■■ 4.03
Top2aQ01320 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC40.21■■■■■ 4.03
Top2aQ01320 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC40.19■■■■■ 4.02
Top2aQ01320 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC40.19■■■■■ 4.02
Top2aQ01320 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.19■■■■■ 4.02
Top2aQ01320 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC40.18■■■■■ 4.02
Top2aQ01320 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC40.17■■■■■ 4.02
Top2aQ01320 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC40.16■■■■■ 4.02
Top2aQ01320 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.15■■■■■ 4.02
Top2aQ01320 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC40.15■■■■■ 4.02
Top2aQ01320 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC40.14■■■■■ 4.02
Top2aQ01320 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.14■■■■■ 4.02
Top2aQ01320 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC40.13■■■■■ 4.02
Top2aQ01320 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.13■■■■■ 4.02
Top2aQ01320 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC40.12■■■■■ 4.01
Top2aQ01320 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC40.12■■■■■ 4.01
Top2aQ01320 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC40.12■■■■■ 4.01
Top2aQ01320 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC40.1■■■■■ 4.01
Top2aQ01320 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.08■■■■■ 4.01
Top2aQ01320 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC40.08■■■■■ 4.01
Top2aQ01320 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC40.07■■■■■ 4.01
Top2aQ01320 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.07■■■■■ 4.01
Top2aQ01320 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.07■■■■■ 4.01
Top2aQ01320 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.06■■■■■ 4
Top2aQ01320 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC40.06■■■■■ 4
Top2aQ01320 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC40.05■■■■■ 4
Top2aQ01320 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC40.04■■■■■ 4
Top2aQ01320 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.04■■■■■ 4
Top2aQ01320 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.03■■■■■ 4
Top2aQ01320 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.03■■■■■ 4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.2 ms