Protein–RNA interactions for Protein: Q00558

F8a1, Factor VIII intron 22 protein, mousemouse

Predictions only

Length 380 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
F8a1Q00558 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
F8a1Q00558 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
F8a1Q00558 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
F8a1Q00558 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
F8a1Q00558 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
F8a1Q00558 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
F8a1Q00558 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
F8a1Q00558 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
F8a1Q00558 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
F8a1Q00558 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
F8a1Q00558 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
F8a1Q00558 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
F8a1Q00558 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
F8a1Q00558 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
F8a1Q00558 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
F8a1Q00558 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
F8a1Q00558 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
F8a1Q00558 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
F8a1Q00558 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
F8a1Q00558 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
F8a1Q00558 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
F8a1Q00558 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
F8a1Q00558 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
F8a1Q00558 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
F8a1Q00558 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
F8a1Q00558 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
F8a1Q00558 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
F8a1Q00558 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
F8a1Q00558 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
F8a1Q00558 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
F8a1Q00558 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
F8a1Q00558 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
F8a1Q00558 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
F8a1Q00558 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
F8a1Q00558 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
F8a1Q00558 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
F8a1Q00558 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
F8a1Q00558 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
F8a1Q00558 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
F8a1Q00558 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
F8a1Q00558 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
F8a1Q00558 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
F8a1Q00558 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
F8a1Q00558 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
F8a1Q00558 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.42
F8a1Q00558 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
F8a1Q00558 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
F8a1Q00558 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
F8a1Q00558 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
F8a1Q00558 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
F8a1Q00558 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
F8a1Q00558 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
F8a1Q00558 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
F8a1Q00558 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
F8a1Q00558 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
F8a1Q00558 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
F8a1Q00558 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC23.85■■□□□ 1.41
F8a1Q00558 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
F8a1Q00558 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
F8a1Q00558 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
F8a1Q00558 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
F8a1Q00558 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
F8a1Q00558 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
F8a1Q00558 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
F8a1Q00558 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
F8a1Q00558 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
F8a1Q00558 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
F8a1Q00558 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
F8a1Q00558 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
F8a1Q00558 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
F8a1Q00558 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
F8a1Q00558 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
F8a1Q00558 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
F8a1Q00558 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
F8a1Q00558 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
F8a1Q00558 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
F8a1Q00558 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
F8a1Q00558 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
F8a1Q00558 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
F8a1Q00558 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
F8a1Q00558 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
F8a1Q00558 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
F8a1Q00558 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
F8a1Q00558 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
F8a1Q00558 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
F8a1Q00558 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
F8a1Q00558 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
F8a1Q00558 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
F8a1Q00558 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
F8a1Q00558 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
F8a1Q00558 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
F8a1Q00558 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
F8a1Q00558 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
F8a1Q00558 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
F8a1Q00558 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
F8a1Q00558 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
F8a1Q00558 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
F8a1Q00558 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
F8a1Q00558 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
F8a1Q00558 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 103.3 ms