Protein–RNA interactions for Protein: P70408

Cdh10, Cadherin-10, mousemouse

Predictions only

Length 788 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdh10P70408 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cdh10P70408 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cdh10P70408 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cdh10P70408 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Cdh10P70408 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Cdh10P70408 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cdh10P70408 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Cdh10P70408 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cdh10P70408 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cdh10P70408 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cdh10P70408 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cdh10P70408 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cdh10P70408 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cdh10P70408 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cdh10P70408 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cdh10P70408 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cdh10P70408 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cdh10P70408 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Cdh10P70408 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cdh10P70408 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cdh10P70408 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cdh10P70408 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cdh10P70408 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cdh10P70408 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cdh10P70408 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cdh10P70408 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cdh10P70408 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cdh10P70408 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Cdh10P70408 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cdh10P70408 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Cdh10P70408 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cdh10P70408 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cdh10P70408 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cdh10P70408 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cdh10P70408 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Cdh10P70408 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Cdh10P70408 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Cdh10P70408 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cdh10P70408 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cdh10P70408 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cdh10P70408 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cdh10P70408 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cdh10P70408 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cdh10P70408 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cdh10P70408 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Cdh10P70408 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Cdh10P70408 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Cdh10P70408 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Cdh10P70408 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Cdh10P70408 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Cdh10P70408 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Cdh10P70408 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Cdh10P70408 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Cdh10P70408 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Cdh10P70408 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Cdh10P70408 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Cdh10P70408 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Cdh10P70408 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Cdh10P70408 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Cdh10P70408 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Cdh10P70408 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Cdh10P70408 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Cdh10P70408 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Cdh10P70408 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Cdh10P70408 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Cdh10P70408 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Cdh10P70408 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Cdh10P70408 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC21.95■■□□□ 1.11
Cdh10P70408 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Cdh10P70408 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Cdh10P70408 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Cdh10P70408 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Cdh10P70408 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Cdh10P70408 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Cdh10P70408 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Cdh10P70408 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Cdh10P70408 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Cdh10P70408 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Cdh10P70408 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Cdh10P70408 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Cdh10P70408 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Cdh10P70408 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Cdh10P70408 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Cdh10P70408 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Cdh10P70408 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Cdh10P70408 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Cdh10P70408 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Cdh10P70408 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Cdh10P70408 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Cdh10P70408 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Cdh10P70408 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Cdh10P70408 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Cdh10P70408 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Cdh10P70408 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Cdh10P70408 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Cdh10P70408 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Cdh10P70408 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Cdh10P70408 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Cdh10P70408 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Cdh10P70408 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 95.3 ms