Protein–RNA interactions for Protein: P70327

Tbx6, T-box transcription factor TBX6, mousemouse

Predictions only

Length 436 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tbx6P70327 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Tbx6P70327 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Tbx6P70327 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Tbx6P70327 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Tbx6P70327 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Tbx6P70327 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Tbx6P70327 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
Tbx6P70327 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Tbx6P70327 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Tbx6P70327 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Tbx6P70327 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Tbx6P70327 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Tbx6P70327 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Tbx6P70327 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Tbx6P70327 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Tbx6P70327 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Tbx6P70327 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Tbx6P70327 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Tbx6P70327 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Tbx6P70327 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Tbx6P70327 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Tbx6P70327 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Tbx6P70327 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Tbx6P70327 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Tbx6P70327 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Tbx6P70327 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Tbx6P70327 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Tbx6P70327 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
Tbx6P70327 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Tbx6P70327 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Tbx6P70327 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Tbx6P70327 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
Tbx6P70327 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Tbx6P70327 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Tbx6P70327 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Tbx6P70327 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Tbx6P70327 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Tbx6P70327 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Tbx6P70327 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Tbx6P70327 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Tbx6P70327 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Tbx6P70327 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
Tbx6P70327 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Tbx6P70327 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Tbx6P70327 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Tbx6P70327 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Tbx6P70327 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Tbx6P70327 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Tbx6P70327 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Tbx6P70327 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
Tbx6P70327 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Tbx6P70327 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Tbx6P70327 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Tbx6P70327 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Tbx6P70327 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Tbx6P70327 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Tbx6P70327 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Tbx6P70327 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Tbx6P70327 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Tbx6P70327 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
Tbx6P70327 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Tbx6P70327 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Tbx6P70327 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Tbx6P70327 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Tbx6P70327 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Tbx6P70327 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Tbx6P70327 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Tbx6P70327 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Tbx6P70327 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Tbx6P70327 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Tbx6P70327 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Tbx6P70327 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Tbx6P70327 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Tbx6P70327 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Tbx6P70327 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Tbx6P70327 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
Tbx6P70327 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Tbx6P70327 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Tbx6P70327 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Tbx6P70327 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Tbx6P70327 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Tbx6P70327 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Tbx6P70327 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Tbx6P70327 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Tbx6P70327 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Tbx6P70327 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
Tbx6P70327 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Tbx6P70327 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
Tbx6P70327 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Tbx6P70327 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Tbx6P70327 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
Tbx6P70327 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Tbx6P70327 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Tbx6P70327 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Tbx6P70327 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Tbx6P70327 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Tbx6P70327 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Tbx6P70327 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Tbx6P70327 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Tbx6P70327 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.4 ms