Protein–RNA interactions for Protein: P70295

Aup1, Ancient ubiquitous protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 410 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Aup1P70295 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Aup1P70295 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Aup1P70295 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Aup1P70295 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Aup1P70295 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Aup1P70295 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Aup1P70295 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Aup1P70295 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Aup1P70295 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
Aup1P70295 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Aup1P70295 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Aup1P70295 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Aup1P70295 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Aup1P70295 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
Aup1P70295 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Aup1P70295 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Aup1P70295 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Aup1P70295 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Aup1P70295 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Aup1P70295 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Aup1P70295 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Aup1P70295 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Aup1P70295 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Aup1P70295 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
Aup1P70295 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Aup1P70295 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Aup1P70295 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
Aup1P70295 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Aup1P70295 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Aup1P70295 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Aup1P70295 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Aup1P70295 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
Aup1P70295 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Aup1P70295 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Aup1P70295 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Aup1P70295 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Aup1P70295 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Aup1P70295 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Aup1P70295 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Aup1P70295 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Aup1P70295 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Aup1P70295 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Aup1P70295 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Aup1P70295 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Aup1P70295 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Aup1P70295 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Aup1P70295 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Aup1P70295 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Aup1P70295 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Aup1P70295 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Aup1P70295 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Aup1P70295 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Aup1P70295 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Aup1P70295 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Aup1P70295 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Aup1P70295 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Aup1P70295 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Aup1P70295 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Aup1P70295 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Aup1P70295 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Aup1P70295 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
Aup1P70295 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Aup1P70295 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Aup1P70295 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
Aup1P70295 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Aup1P70295 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Aup1P70295 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Aup1P70295 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Aup1P70295 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Aup1P70295 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Aup1P70295 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Aup1P70295 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Aup1P70295 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Aup1P70295 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Aup1P70295 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Aup1P70295 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Aup1P70295 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Aup1P70295 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Aup1P70295 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Aup1P70295 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Aup1P70295 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Aup1P70295 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Aup1P70295 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Aup1P70295 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Aup1P70295 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Aup1P70295 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
Aup1P70295 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Aup1P70295 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Aup1P70295 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Aup1P70295 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Aup1P70295 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Aup1P70295 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Aup1P70295 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Aup1P70295 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Aup1P70295 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Aup1P70295 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
Aup1P70295 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Aup1P70295 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Aup1P70295 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
Aup1P70295 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.1 ms