Protein–RNA interactions for Protein: P70208

Plxna3, Plexin-A3, mousemouse

Predictions only

Length 1,872 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Plxna3P70208 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
Plxna3P70208 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
Plxna3P70208 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
Plxna3P70208 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Plxna3P70208 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Plxna3P70208 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Plxna3P70208 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Plxna3P70208 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
Plxna3P70208 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Plxna3P70208 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Plxna3P70208 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Plxna3P70208 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Plxna3P70208 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Plxna3P70208 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Plxna3P70208 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Plxna3P70208 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
Plxna3P70208 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Plxna3P70208 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Plxna3P70208 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Plxna3P70208 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Plxna3P70208 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Plxna3P70208 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Plxna3P70208 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Plxna3P70208 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Plxna3P70208 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Plxna3P70208 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Plxna3P70208 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Plxna3P70208 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Plxna3P70208 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Plxna3P70208 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
Plxna3P70208 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
Plxna3P70208 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Plxna3P70208 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Plxna3P70208 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Plxna3P70208 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Plxna3P70208 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Plxna3P70208 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Plxna3P70208 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Plxna3P70208 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Plxna3P70208 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Plxna3P70208 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Plxna3P70208 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
Plxna3P70208 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Plxna3P70208 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Plxna3P70208 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Plxna3P70208 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Plxna3P70208 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Plxna3P70208 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Plxna3P70208 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Plxna3P70208 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Plxna3P70208 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Plxna3P70208 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Plxna3P70208 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Plxna3P70208 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Plxna3P70208 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Plxna3P70208 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Plxna3P70208 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Plxna3P70208 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Plxna3P70208 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Plxna3P70208 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Plxna3P70208 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Plxna3P70208 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Plxna3P70208 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Plxna3P70208 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Plxna3P70208 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Plxna3P70208 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Plxna3P70208 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
Plxna3P70208 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Plxna3P70208 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Plxna3P70208 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Plxna3P70208 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Plxna3P70208 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Plxna3P70208 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Plxna3P70208 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Plxna3P70208 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Plxna3P70208 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
Plxna3P70208 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Plxna3P70208 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Plxna3P70208 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Plxna3P70208 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Plxna3P70208 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Plxna3P70208 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Plxna3P70208 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Plxna3P70208 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Plxna3P70208 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Plxna3P70208 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
Plxna3P70208 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Plxna3P70208 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Plxna3P70208 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Plxna3P70208 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
Plxna3P70208 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Plxna3P70208 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Plxna3P70208 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Plxna3P70208 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Plxna3P70208 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Plxna3P70208 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Plxna3P70208 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Plxna3P70208 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Plxna3P70208 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Plxna3P70208 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.5 ms