Protein–RNA interactions for Protein: P70174

Hrh1, Histamine H1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 488 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hrh1P70174 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Hrh1P70174 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Hrh1P70174 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Hrh1P70174 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Hrh1P70174 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Hrh1P70174 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Hrh1P70174 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Hrh1P70174 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Hrh1P70174 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Hrh1P70174 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Hrh1P70174 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Hrh1P70174 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
Hrh1P70174 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Hrh1P70174 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Hrh1P70174 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Hrh1P70174 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
Hrh1P70174 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Hrh1P70174 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Hrh1P70174 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Hrh1P70174 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
Hrh1P70174 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Hrh1P70174 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
Hrh1P70174 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Hrh1P70174 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
Hrh1P70174 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Hrh1P70174 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Hrh1P70174 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Hrh1P70174 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Hrh1P70174 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Hrh1P70174 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Hrh1P70174 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Hrh1P70174 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
Hrh1P70174 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Hrh1P70174 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Hrh1P70174 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Hrh1P70174 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Hrh1P70174 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Hrh1P70174 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Hrh1P70174 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Hrh1P70174 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Hrh1P70174 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Hrh1P70174 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Hrh1P70174 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Hrh1P70174 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Hrh1P70174 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Hrh1P70174 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Hrh1P70174 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Hrh1P70174 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Hrh1P70174 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Hrh1P70174 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Hrh1P70174 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Hrh1P70174 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Hrh1P70174 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
Hrh1P70174 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Hrh1P70174 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Hrh1P70174 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Hrh1P70174 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Hrh1P70174 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Hrh1P70174 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Hrh1P70174 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Hrh1P70174 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Hrh1P70174 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Hrh1P70174 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Hrh1P70174 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
Hrh1P70174 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Hrh1P70174 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Hrh1P70174 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Hrh1P70174 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Hrh1P70174 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Hrh1P70174 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Hrh1P70174 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Hrh1P70174 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Hrh1P70174 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Hrh1P70174 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Hrh1P70174 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Hrh1P70174 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Hrh1P70174 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Hrh1P70174 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Hrh1P70174 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Hrh1P70174 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Hrh1P70174 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Hrh1P70174 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Hrh1P70174 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Hrh1P70174 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Hrh1P70174 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Hrh1P70174 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Hrh1P70174 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Hrh1P70174 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Hrh1P70174 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Hrh1P70174 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Hrh1P70174 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Hrh1P70174 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Hrh1P70174 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Hrh1P70174 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Hrh1P70174 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Hrh1P70174 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Hrh1P70174 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Hrh1P70174 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Hrh1P70174 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Hrh1P70174 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.6 ms