Protein–RNA interactions for Protein: P63143

Kcnab1, Voltage-gated potassium channel subunit beta-1, mousemouse

Predictions only

Length 401 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcnab1P63143 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Kcnab1P63143 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Kcnab1P63143 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Kcnab1P63143 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Kcnab1P63143 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Kcnab1P63143 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Kcnab1P63143 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Kcnab1P63143 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Kcnab1P63143 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Kcnab1P63143 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Kcnab1P63143 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Kcnab1P63143 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Kcnab1P63143 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Kcnab1P63143 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Kcnab1P63143 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Kcnab1P63143 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
Kcnab1P63143 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Kcnab1P63143 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Kcnab1P63143 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Kcnab1P63143 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Kcnab1P63143 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Kcnab1P63143 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Kcnab1P63143 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Kcnab1P63143 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Kcnab1P63143 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Kcnab1P63143 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Kcnab1P63143 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Kcnab1P63143 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Kcnab1P63143 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Kcnab1P63143 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Kcnab1P63143 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Kcnab1P63143 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Kcnab1P63143 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Kcnab1P63143 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Kcnab1P63143 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Kcnab1P63143 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Kcnab1P63143 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Kcnab1P63143 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Kcnab1P63143 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Kcnab1P63143 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Kcnab1P63143 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Kcnab1P63143 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Kcnab1P63143 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
Kcnab1P63143 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Kcnab1P63143 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Kcnab1P63143 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Kcnab1P63143 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Kcnab1P63143 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Kcnab1P63143 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Kcnab1P63143 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Kcnab1P63143 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
Kcnab1P63143 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Kcnab1P63143 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Kcnab1P63143 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
Kcnab1P63143 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Kcnab1P63143 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Kcnab1P63143 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Kcnab1P63143 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Kcnab1P63143 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Kcnab1P63143 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Kcnab1P63143 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Kcnab1P63143 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Kcnab1P63143 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Kcnab1P63143 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Kcnab1P63143 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Kcnab1P63143 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
Kcnab1P63143 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Kcnab1P63143 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Kcnab1P63143 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Kcnab1P63143 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Kcnab1P63143 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Kcnab1P63143 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Kcnab1P63143 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Kcnab1P63143 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Kcnab1P63143 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Kcnab1P63143 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Kcnab1P63143 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Kcnab1P63143 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Kcnab1P63143 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Kcnab1P63143 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Kcnab1P63143 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Kcnab1P63143 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Kcnab1P63143 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Kcnab1P63143 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Kcnab1P63143 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Kcnab1P63143 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
Kcnab1P63143 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Kcnab1P63143 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Kcnab1P63143 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Kcnab1P63143 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Kcnab1P63143 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Kcnab1P63143 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Kcnab1P63143 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
Kcnab1P63143 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Kcnab1P63143 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Kcnab1P63143 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Kcnab1P63143 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Kcnab1P63143 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Kcnab1P63143 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Kcnab1P63143 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.2 ms