Protein–RNA interactions for Protein: P63089

Ptn, Pleiotrophin, mousemouse

Predictions only

Length 168 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtnP63089 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PtnP63089 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PtnP63089 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PtnP63089 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PtnP63089 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PtnP63089 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PtnP63089 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
PtnP63089 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
PtnP63089 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
PtnP63089 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PtnP63089 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PtnP63089 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PtnP63089 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PtnP63089 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PtnP63089 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PtnP63089 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PtnP63089 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PtnP63089 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PtnP63089 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PtnP63089 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PtnP63089 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PtnP63089 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PtnP63089 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PtnP63089 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
PtnP63089 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PtnP63089 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PtnP63089 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PtnP63089 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PtnP63089 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PtnP63089 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PtnP63089 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PtnP63089 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PtnP63089 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
PtnP63089 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
PtnP63089 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PtnP63089 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PtnP63089 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PtnP63089 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PtnP63089 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PtnP63089 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PtnP63089 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PtnP63089 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PtnP63089 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PtnP63089 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PtnP63089 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PtnP63089 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PtnP63089 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PtnP63089 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PtnP63089 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PtnP63089 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PtnP63089 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PtnP63089 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PtnP63089 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PtnP63089 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PtnP63089 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PtnP63089 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PtnP63089 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PtnP63089 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
PtnP63089 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
PtnP63089 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PtnP63089 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PtnP63089 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PtnP63089 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PtnP63089 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PtnP63089 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PtnP63089 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PtnP63089 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PtnP63089 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PtnP63089 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
PtnP63089 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PtnP63089 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PtnP63089 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PtnP63089 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PtnP63089 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PtnP63089 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PtnP63089 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
PtnP63089 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PtnP63089 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PtnP63089 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PtnP63089 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PtnP63089 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PtnP63089 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
PtnP63089 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
PtnP63089 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PtnP63089 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
PtnP63089 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
PtnP63089 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PtnP63089 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
PtnP63089 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
PtnP63089 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PtnP63089 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PtnP63089 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PtnP63089 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PtnP63089 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PtnP63089 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PtnP63089 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PtnP63089 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PtnP63089 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
PtnP63089 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PtnP63089 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.8 ms