Protein–RNA interactions for Protein: P62812

Gabra1, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit alpha-1, mousemouse

Predictions only

Length 455 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gabra1P62812 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Gabra1P62812 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Gabra1P62812 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Gabra1P62812 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Gabra1P62812 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Gabra1P62812 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Gabra1P62812 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Gabra1P62812 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
Gabra1P62812 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Gabra1P62812 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Gabra1P62812 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Gabra1P62812 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Gabra1P62812 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Gabra1P62812 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Gabra1P62812 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Gabra1P62812 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Gabra1P62812 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Gabra1P62812 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Gabra1P62812 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Gabra1P62812 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
Gabra1P62812 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Gabra1P62812 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Gabra1P62812 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
Gabra1P62812 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Gabra1P62812 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Gabra1P62812 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Gabra1P62812 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Gabra1P62812 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Gabra1P62812 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Gabra1P62812 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Gabra1P62812 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Gabra1P62812 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Gabra1P62812 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Gabra1P62812 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Gabra1P62812 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Gabra1P62812 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Gabra1P62812 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Gabra1P62812 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Gabra1P62812 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Gabra1P62812 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Gabra1P62812 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Gabra1P62812 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Gabra1P62812 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Gabra1P62812 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Gabra1P62812 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Gabra1P62812 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Gabra1P62812 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Gabra1P62812 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Gabra1P62812 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Gabra1P62812 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Gabra1P62812 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Gabra1P62812 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Gabra1P62812 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Gabra1P62812 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Gabra1P62812 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Gabra1P62812 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Gabra1P62812 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Gabra1P62812 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Gabra1P62812 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gabra1P62812 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gabra1P62812 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gabra1P62812 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gabra1P62812 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gabra1P62812 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gabra1P62812 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Gabra1P62812 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Gabra1P62812 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Gabra1P62812 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Gabra1P62812 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Gabra1P62812 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Gabra1P62812 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Gabra1P62812 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Gabra1P62812 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Gabra1P62812 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Gabra1P62812 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Gabra1P62812 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Gabra1P62812 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Gabra1P62812 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Gabra1P62812 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Gabra1P62812 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Gabra1P62812 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Gabra1P62812 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Gabra1P62812 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Gabra1P62812 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Gabra1P62812 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Gabra1P62812 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Gabra1P62812 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Gabra1P62812 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Gabra1P62812 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
Gabra1P62812 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Gabra1P62812 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Gabra1P62812 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Gabra1P62812 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
Gabra1P62812 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Gabra1P62812 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Gabra1P62812 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Gabra1P62812 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Gabra1P62812 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Gabra1P62812 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Gabra1P62812 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 113.3 ms