Protein–RNA interactions for Protein: P62748

Hpcal1, Hippocalcin-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 193 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hpcal1P62748 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Hpcal1P62748 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Hpcal1P62748 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Hpcal1P62748 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Hpcal1P62748 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Hpcal1P62748 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Hpcal1P62748 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Hpcal1P62748 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Hpcal1P62748 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Hpcal1P62748 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Hpcal1P62748 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Hpcal1P62748 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Hpcal1P62748 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Hpcal1P62748 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Hpcal1P62748 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Hpcal1P62748 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Hpcal1P62748 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Hpcal1P62748 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Hpcal1P62748 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Hpcal1P62748 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Hpcal1P62748 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Hpcal1P62748 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Hpcal1P62748 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Hpcal1P62748 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Hpcal1P62748 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Hpcal1P62748 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Hpcal1P62748 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Hpcal1P62748 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Hpcal1P62748 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Hpcal1P62748 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Hpcal1P62748 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Hpcal1P62748 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Hpcal1P62748 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Hpcal1P62748 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Hpcal1P62748 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Hpcal1P62748 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Hpcal1P62748 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Hpcal1P62748 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Hpcal1P62748 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Hpcal1P62748 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Hpcal1P62748 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Hpcal1P62748 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Hpcal1P62748 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Hpcal1P62748 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Hpcal1P62748 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Hpcal1P62748 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Hpcal1P62748 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Hpcal1P62748 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Hpcal1P62748 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Hpcal1P62748 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Hpcal1P62748 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Hpcal1P62748 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Hpcal1P62748 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Hpcal1P62748 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Hpcal1P62748 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Hpcal1P62748 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Hpcal1P62748 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Hpcal1P62748 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Hpcal1P62748 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Hpcal1P62748 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Hpcal1P62748 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Hpcal1P62748 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Hpcal1P62748 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Hpcal1P62748 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Hpcal1P62748 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Hpcal1P62748 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Hpcal1P62748 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Hpcal1P62748 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Hpcal1P62748 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Hpcal1P62748 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
Hpcal1P62748 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Hpcal1P62748 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Hpcal1P62748 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Hpcal1P62748 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Hpcal1P62748 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
Hpcal1P62748 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Hpcal1P62748 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Hpcal1P62748 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Hpcal1P62748 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
Hpcal1P62748 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Hpcal1P62748 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Hpcal1P62748 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Hpcal1P62748 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Hpcal1P62748 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Hpcal1P62748 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Hpcal1P62748 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Hpcal1P62748 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Hpcal1P62748 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Hpcal1P62748 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Hpcal1P62748 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Hpcal1P62748 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Hpcal1P62748 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Hpcal1P62748 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Hpcal1P62748 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Hpcal1P62748 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
Hpcal1P62748 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Hpcal1P62748 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
Hpcal1P62748 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Hpcal1P62748 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Hpcal1P62748 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 105.4 ms