Protein–RNA interactions for Protein: P62717

Rpl18a, 60S ribosomal protein L18a, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 176 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl18aP62717 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rpl18aP62717 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rpl18aP62717 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rpl18aP62717 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rpl18aP62717 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rpl18aP62717 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rpl18aP62717 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rpl18aP62717 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rpl18aP62717 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rpl18aP62717 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rpl18aP62717 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rpl18aP62717 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rpl18aP62717 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rpl18aP62717 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rpl18aP62717 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rpl18aP62717 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rpl18aP62717 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rpl18aP62717 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Rpl18aP62717 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rpl18aP62717 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rpl18aP62717 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rpl18aP62717 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
Rpl18aP62717 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rpl18aP62717 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rpl18aP62717 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rpl18aP62717 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Rpl18aP62717 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rpl18aP62717 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rpl18aP62717 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rpl18aP62717 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rpl18aP62717 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rpl18aP62717 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rpl18aP62717 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rpl18aP62717 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rpl18aP62717 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rpl18aP62717 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rpl18aP62717 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rpl18aP62717 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Rpl18aP62717 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rpl18aP62717 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rpl18aP62717 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Rpl18aP62717 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Rpl18aP62717 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rpl18aP62717 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rpl18aP62717 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rpl18aP62717 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rpl18aP62717 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rpl18aP62717 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rpl18aP62717 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rpl18aP62717 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rpl18aP62717 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rpl18aP62717 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rpl18aP62717 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Rpl18aP62717 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rpl18aP62717 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rpl18aP62717 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rpl18aP62717 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rpl18aP62717 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rpl18aP62717 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rpl18aP62717 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rpl18aP62717 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rpl18aP62717 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rpl18aP62717 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rpl18aP62717 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rpl18aP62717 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rpl18aP62717 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rpl18aP62717 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rpl18aP62717 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rpl18aP62717 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rpl18aP62717 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rpl18aP62717 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rpl18aP62717 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rpl18aP62717 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rpl18aP62717 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rpl18aP62717 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rpl18aP62717 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rpl18aP62717 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rpl18aP62717 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rpl18aP62717 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rpl18aP62717 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rpl18aP62717 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rpl18aP62717 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rpl18aP62717 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Rpl18aP62717 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rpl18aP62717 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rpl18aP62717 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rpl18aP62717 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rpl18aP62717 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rpl18aP62717 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rpl18aP62717 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rpl18aP62717 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rpl18aP62717 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rpl18aP62717 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rpl18aP62717 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rpl18aP62717 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rpl18aP62717 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rpl18aP62717 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rpl18aP62717 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rpl18aP62717 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rpl18aP62717 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
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