Protein–RNA interactions for Protein: P62702

Rps4x, 40S ribosomal protein S4, X isoform, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 263 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rps4xP62702 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Rps4xP62702 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Rps4xP62702 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Rps4xP62702 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Rps4xP62702 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Rps4xP62702 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Rps4xP62702 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Rps4xP62702 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Rps4xP62702 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Rps4xP62702 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.11
Rps4xP62702 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Rps4xP62702 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Rps4xP62702 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Rps4xP62702 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Rps4xP62702 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Rps4xP62702 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Rps4xP62702 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Rps4xP62702 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Rps4xP62702 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Rps4xP62702 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Rps4xP62702 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Rps4xP62702 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Rps4xP62702 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Rps4xP62702 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Rps4xP62702 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Rps4xP62702 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Rps4xP62702 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Rps4xP62702 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Rps4xP62702 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Rps4xP62702 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Rps4xP62702 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Rps4xP62702 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Rps4xP62702 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Rps4xP62702 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Rps4xP62702 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Rps4xP62702 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
Rps4xP62702 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Rps4xP62702 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Rps4xP62702 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Rps4xP62702 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Rps4xP62702 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Rps4xP62702 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Rps4xP62702 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Rps4xP62702 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Rps4xP62702 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Rps4xP62702 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Rps4xP62702 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Rps4xP62702 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Rps4xP62702 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Rps4xP62702 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Rps4xP62702 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Rps4xP62702 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Rps4xP62702 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Rps4xP62702 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Rps4xP62702 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Rps4xP62702 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Rps4xP62702 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Rps4xP62702 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Rps4xP62702 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Rps4xP62702 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Rps4xP62702 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Rps4xP62702 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Rps4xP62702 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Rps4xP62702 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Rps4xP62702 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Rps4xP62702 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Rps4xP62702 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Rps4xP62702 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Rps4xP62702 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
Rps4xP62702 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Rps4xP62702 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Rps4xP62702 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Rps4xP62702 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Rps4xP62702 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
Rps4xP62702 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Rps4xP62702 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Rps4xP62702 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Rps4xP62702 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Rps4xP62702 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Rps4xP62702 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Rps4xP62702 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Rps4xP62702 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Rps4xP62702 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Rps4xP62702 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Rps4xP62702 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Rps4xP62702 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Rps4xP62702 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Rps4xP62702 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
Rps4xP62702 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Rps4xP62702 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Rps4xP62702 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Rps4xP62702 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Rps4xP62702 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Rps4xP62702 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Rps4xP62702 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Rps4xP62702 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Rps4xP62702 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Rps4xP62702 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Rps4xP62702 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Rps4xP62702 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 75.4 ms