Protein–RNA interactions for Protein: P59997

Kdm2a, Lysine-specific demethylase 2A, mousemouse

Predictions only

Length 1,161 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kdm2aP59997 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC34.66■■■■□ 3.14
Kdm2aP59997 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC34.66■■■■□ 3.14
Kdm2aP59997 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.66■■■■□ 3.14
Kdm2aP59997 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC34.64■■■■□ 3.14
Kdm2aP59997 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC34.64■■■■□ 3.14
Kdm2aP59997 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.64■■■■□ 3.14
Kdm2aP59997 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC34.64■■■■□ 3.14
Kdm2aP59997 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC34.63■■■■□ 3.13
Kdm2aP59997 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC34.63■■■■□ 3.13
Kdm2aP59997 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC34.6■■■■□ 3.13
Kdm2aP59997 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC34.58■■■■□ 3.13
Kdm2aP59997 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.58■■■■□ 3.13
Kdm2aP59997 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC34.56■■■■□ 3.12
Kdm2aP59997 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.56■■■■□ 3.12
Kdm2aP59997 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC34.55■■■■□ 3.12
Kdm2aP59997 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC34.55■■■■□ 3.12
Kdm2aP59997 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.54■■■■□ 3.12
Kdm2aP59997 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.54■■■■□ 3.12
Kdm2aP59997 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC34.54■■■■□ 3.12
Kdm2aP59997 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.53■■■■□ 3.12
Kdm2aP59997 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC34.53■■■■□ 3.12
Kdm2aP59997 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.53■■■■□ 3.12
Kdm2aP59997 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.52■■■■□ 3.12
Kdm2aP59997 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC34.52■■■■□ 3.12
Kdm2aP59997 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC34.51■■■■□ 3.12
Kdm2aP59997 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.49■■■■□ 3.11
Kdm2aP59997 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.48■■■■□ 3.11
Kdm2aP59997 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC34.47■■■■□ 3.11
Kdm2aP59997 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC34.46■■■■□ 3.11
Kdm2aP59997 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.45■■■■□ 3.11
Kdm2aP59997 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC34.45■■■■□ 3.11
Kdm2aP59997 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.44■■■■□ 3.1
Kdm2aP59997 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC34.43■■■■□ 3.1
Kdm2aP59997 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC34.43■■■■□ 3.1
Kdm2aP59997 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC34.4■■■■□ 3.1
Kdm2aP59997 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.4■■■■□ 3.1
Kdm2aP59997 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC34.38■■■■□ 3.09
Kdm2aP59997 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.36■■■■□ 3.09
Kdm2aP59997 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.36■■■■□ 3.09
Kdm2aP59997 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC34.36■■■■□ 3.09
Kdm2aP59997 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC34.35■■■■□ 3.09
Kdm2aP59997 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.34■■■■□ 3.09
Kdm2aP59997 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC34.33■■■■□ 3.09
Kdm2aP59997 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC34.33■■■■□ 3.09
Kdm2aP59997 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC34.33■■■■□ 3.09
Kdm2aP59997 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC34.33■■■■□ 3.09
Kdm2aP59997 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC34.33■■■■□ 3.09
Kdm2aP59997 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC34.32■■■■□ 3.08
Kdm2aP59997 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC34.31■■■■□ 3.08
Kdm2aP59997 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC34.31■■■■□ 3.08
Kdm2aP59997 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC34.31■■■■□ 3.08
Kdm2aP59997 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.31■■■■□ 3.08
Kdm2aP59997 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC34.3■■■■□ 3.08
Kdm2aP59997 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.3■■■■□ 3.08
Kdm2aP59997 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC34.29■■■■□ 3.08
Kdm2aP59997 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC34.29■■■■□ 3.08
Kdm2aP59997 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC34.29■■■■□ 3.08
Kdm2aP59997 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC34.28■■■■□ 3.08
Kdm2aP59997 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.28■■■■□ 3.08
Kdm2aP59997 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC34.28■■■■□ 3.08
Kdm2aP59997 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC34.27■■■■□ 3.08
Kdm2aP59997 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC34.27■■■■□ 3.08
Kdm2aP59997 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.27■■■■□ 3.08
Kdm2aP59997 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC34.26■■■■□ 3.08
Kdm2aP59997 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.26■■■■□ 3.07
Kdm2aP59997 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.25■■■■□ 3.07
Kdm2aP59997 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC34.24■■■■□ 3.07
Kdm2aP59997 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC34.23■■■■□ 3.07
Kdm2aP59997 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.23■■■■□ 3.07
Kdm2aP59997 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.23■■■■□ 3.07
Kdm2aP59997 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC34.22■■■■□ 3.07
Kdm2aP59997 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.22■■■■□ 3.07
Kdm2aP59997 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC34.21■■■■□ 3.07
Kdm2aP59997 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.07
Kdm2aP59997 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.19■■■■□ 3.06
Kdm2aP59997 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC34.19■■■■□ 3.06
Kdm2aP59997 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC34.18■■■■□ 3.06
Kdm2aP59997 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.18■■■■□ 3.06
Kdm2aP59997 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.17■■■■□ 3.06
Kdm2aP59997 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.17■■■■□ 3.06
Kdm2aP59997 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
Kdm2aP59997 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
Kdm2aP59997 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
Kdm2aP59997 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC34.14■■■■□ 3.06
Kdm2aP59997 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
Kdm2aP59997 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC34.13■■■■□ 3.05
Kdm2aP59997 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC34.13■■■■□ 3.05
Kdm2aP59997 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC34.13■■■■□ 3.05
Kdm2aP59997 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
Kdm2aP59997 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC34.12■■■■□ 3.05
Kdm2aP59997 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
Kdm2aP59997 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
Kdm2aP59997 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.09■■■■□ 3.05
Kdm2aP59997 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
Kdm2aP59997 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
Kdm2aP59997 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC34.07■■■■□ 3.05
Kdm2aP59997 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.04
Kdm2aP59997 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC34.07■■■■□ 3.04
Kdm2aP59997 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.06■■■■□ 3.04
Kdm2aP59997 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.06■■■■□ 3.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.7 ms