Protein–RNA interactions for Protein: P59242

Cgn, Cingulin, mousemouse

Predictions only

Length 1,191 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CgnP59242 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.12
CgnP59242 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
CgnP59242 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC28.31■■■□□ 2.12
CgnP59242 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
CgnP59242 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
CgnP59242 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
CgnP59242 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
CgnP59242 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
CgnP59242 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
CgnP59242 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
CgnP59242 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
CgnP59242 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
CgnP59242 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
CgnP59242 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
CgnP59242 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
CgnP59242 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
CgnP59242 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
CgnP59242 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
CgnP59242 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
CgnP59242 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
CgnP59242 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
CgnP59242 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC28.2■■■□□ 2.1
CgnP59242 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
CgnP59242 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
CgnP59242 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
CgnP59242 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
CgnP59242 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
CgnP59242 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
CgnP59242 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
CgnP59242 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
CgnP59242 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
CgnP59242 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
CgnP59242 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
CgnP59242 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
CgnP59242 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
CgnP59242 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
CgnP59242 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
CgnP59242 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
CgnP59242 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
CgnP59242 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC28.09■■■□□ 2.09
CgnP59242 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
CgnP59242 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
CgnP59242 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
CgnP59242 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
CgnP59242 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
CgnP59242 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
CgnP59242 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
CgnP59242 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
CgnP59242 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
CgnP59242 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
CgnP59242 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
CgnP59242 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
CgnP59242 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
CgnP59242 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
CgnP59242 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
CgnP59242 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
CgnP59242 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
CgnP59242 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
CgnP59242 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC28.02■■■□□ 2.08
CgnP59242 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
CgnP59242 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
CgnP59242 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
CgnP59242 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
CgnP59242 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
CgnP59242 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
CgnP59242 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC27.99■■■□□ 2.07
CgnP59242 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
CgnP59242 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
CgnP59242 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
CgnP59242 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
CgnP59242 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC27.97■■■□□ 2.07
CgnP59242 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
CgnP59242 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
CgnP59242 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
CgnP59242 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
CgnP59242 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
CgnP59242 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
CgnP59242 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.07
CgnP59242 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
CgnP59242 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
CgnP59242 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
CgnP59242 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
CgnP59242 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
CgnP59242 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
CgnP59242 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
CgnP59242 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
CgnP59242 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
CgnP59242 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
CgnP59242 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
CgnP59242 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
CgnP59242 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
CgnP59242 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC27.9■■■□□ 2.06
CgnP59242 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
CgnP59242 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
CgnP59242 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
CgnP59242 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
CgnP59242 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
CgnP59242 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
CgnP59242 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
CgnP59242 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.7 ms