Protein–RNA interactions for Protein: P58467

Setd4, SET domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 439 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Setd4P58467 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
Setd4P58467 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Setd4P58467 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Setd4P58467 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Setd4P58467 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Setd4P58467 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Setd4P58467 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Setd4P58467 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Setd4P58467 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
Setd4P58467 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
Setd4P58467 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Setd4P58467 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.96
Setd4P58467 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Setd4P58467 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
Setd4P58467 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Setd4P58467 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
Setd4P58467 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
Setd4P58467 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
Setd4P58467 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Setd4P58467 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
Setd4P58467 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Setd4P58467 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Setd4P58467 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Setd4P58467 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Setd4P58467 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Setd4P58467 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
Setd4P58467 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
Setd4P58467 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Setd4P58467 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Setd4P58467 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Setd4P58467 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
Setd4P58467 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
Setd4P58467 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Setd4P58467 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Setd4P58467 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
Setd4P58467 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Setd4P58467 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
Setd4P58467 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Setd4P58467 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Setd4P58467 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
Setd4P58467 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Setd4P58467 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
Setd4P58467 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Setd4P58467 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Setd4P58467 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
Setd4P58467 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
Setd4P58467 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Setd4P58467 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Setd4P58467 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Setd4P58467 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
Setd4P58467 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Setd4P58467 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Setd4P58467 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Setd4P58467 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Setd4P58467 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Setd4P58467 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
Setd4P58467 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Setd4P58467 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
Setd4P58467 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC27.02■■□□□ 1.92
Setd4P58467 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
Setd4P58467 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
Setd4P58467 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Setd4P58467 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Setd4P58467 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Setd4P58467 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Setd4P58467 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
Setd4P58467 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Setd4P58467 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Setd4P58467 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Setd4P58467 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Setd4P58467 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Setd4P58467 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Setd4P58467 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Setd4P58467 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
Setd4P58467 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Setd4P58467 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Setd4P58467 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Setd4P58467 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Setd4P58467 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Setd4P58467 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Setd4P58467 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
Setd4P58467 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Setd4P58467 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
Setd4P58467 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Setd4P58467 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Setd4P58467 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Setd4P58467 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC26.83■■□□□ 1.88
Setd4P58467 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Setd4P58467 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
Setd4P58467 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Setd4P58467 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Setd4P58467 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC26.81■■□□□ 1.88
Setd4P58467 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Setd4P58467 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
Setd4P58467 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Setd4P58467 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Setd4P58467 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Setd4P58467 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Setd4P58467 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Setd4P58467 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.1 ms