Protein–RNA interactions for Protein: P58021

Tm9sf2, Transmembrane 9 superfamily member 2, mousemouse

Predictions only

Length 662 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tm9sf2P58021 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Tm9sf2P58021 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Tm9sf2P58021 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Tm9sf2P58021 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Tm9sf2P58021 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Tm9sf2P58021 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Tm9sf2P58021 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
Tm9sf2P58021 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Tm9sf2P58021 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Tm9sf2P58021 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Tm9sf2P58021 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Tm9sf2P58021 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Tm9sf2P58021 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Tm9sf2P58021 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Tm9sf2P58021 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Tm9sf2P58021 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Tm9sf2P58021 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Tm9sf2P58021 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Tm9sf2P58021 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Tm9sf2P58021 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Tm9sf2P58021 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Tm9sf2P58021 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Tm9sf2P58021 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Tm9sf2P58021 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Tm9sf2P58021 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Tm9sf2P58021 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Tm9sf2P58021 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
Tm9sf2P58021 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Tm9sf2P58021 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Tm9sf2P58021 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Tm9sf2P58021 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Tm9sf2P58021 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Tm9sf2P58021 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Tm9sf2P58021 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Tm9sf2P58021 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Tm9sf2P58021 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Tm9sf2P58021 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Tm9sf2P58021 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Tm9sf2P58021 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
Tm9sf2P58021 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Tm9sf2P58021 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Tm9sf2P58021 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Tm9sf2P58021 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Tm9sf2P58021 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Tm9sf2P58021 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Tm9sf2P58021 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Tm9sf2P58021 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
Tm9sf2P58021 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Tm9sf2P58021 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Tm9sf2P58021 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Tm9sf2P58021 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Tm9sf2P58021 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
Tm9sf2P58021 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
Tm9sf2P58021 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Tm9sf2P58021 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Tm9sf2P58021 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Tm9sf2P58021 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Tm9sf2P58021 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
Tm9sf2P58021 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Tm9sf2P58021 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Tm9sf2P58021 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Tm9sf2P58021 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Tm9sf2P58021 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Tm9sf2P58021 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Tm9sf2P58021 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Tm9sf2P58021 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Tm9sf2P58021 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Tm9sf2P58021 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Tm9sf2P58021 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Tm9sf2P58021 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Tm9sf2P58021 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Tm9sf2P58021 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
Tm9sf2P58021 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Tm9sf2P58021 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Tm9sf2P58021 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Tm9sf2P58021 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Tm9sf2P58021 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Tm9sf2P58021 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Tm9sf2P58021 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Tm9sf2P58021 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Tm9sf2P58021 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Tm9sf2P58021 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Tm9sf2P58021 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Tm9sf2P58021 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Tm9sf2P58021 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Tm9sf2P58021 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Tm9sf2P58021 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
Tm9sf2P58021 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Tm9sf2P58021 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Tm9sf2P58021 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Tm9sf2P58021 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Tm9sf2P58021 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Tm9sf2P58021 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Tm9sf2P58021 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Tm9sf2P58021 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Tm9sf2P58021 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
Tm9sf2P58021 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Tm9sf2P58021 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Tm9sf2P58021 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Tm9sf2P58021 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.7 ms