Protein–RNA interactions for Protein: P57780

Actn4, Alpha-actinin-4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 912 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Actn4P57780 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Actn4P57780 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Actn4P57780 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Actn4P57780 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Actn4P57780 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Actn4P57780 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Actn4P57780 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Actn4P57780 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Actn4P57780 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Actn4P57780 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Actn4P57780 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Actn4P57780 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Actn4P57780 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Actn4P57780 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Actn4P57780 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
Actn4P57780 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Actn4P57780 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Actn4P57780 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Actn4P57780 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Actn4P57780 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Actn4P57780 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
Actn4P57780 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Actn4P57780 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Actn4P57780 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Actn4P57780 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC26.08■■□□□ 1.77
Actn4P57780 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Actn4P57780 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Actn4P57780 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Actn4P57780 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Actn4P57780 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Actn4P57780 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Actn4P57780 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Actn4P57780 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Actn4P57780 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
Actn4P57780 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Actn4P57780 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Actn4P57780 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Actn4P57780 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Actn4P57780 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Actn4P57780 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Actn4P57780 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Actn4P57780 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Actn4P57780 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Actn4P57780 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Actn4P57780 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Actn4P57780 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Actn4P57780 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Actn4P57780 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Actn4P57780 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Actn4P57780 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Actn4P57780 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
Actn4P57780 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Actn4P57780 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Actn4P57780 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Actn4P57780 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Actn4P57780 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Actn4P57780 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Actn4P57780 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Actn4P57780 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Actn4P57780 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
Actn4P57780 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Actn4P57780 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Actn4P57780 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Actn4P57780 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Actn4P57780 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Actn4P57780 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Actn4P57780 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Actn4P57780 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Actn4P57780 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Actn4P57780 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Actn4P57780 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Actn4P57780 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Actn4P57780 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Actn4P57780 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Actn4P57780 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
Actn4P57780 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
Actn4P57780 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Actn4P57780 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Actn4P57780 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Actn4P57780 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Actn4P57780 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Actn4P57780 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Actn4P57780 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Actn4P57780 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Actn4P57780 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Actn4P57780 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
Actn4P57780 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Actn4P57780 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Actn4P57780 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Actn4P57780 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Actn4P57780 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Actn4P57780 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Actn4P57780 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Actn4P57780 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Actn4P57780 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Actn4P57780 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
Actn4P57780 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
Actn4P57780 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Actn4P57780 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
Actn4P57780 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.5 ms