Protein–RNA interactions for Protein: P57725

Samsn1, SAM domain-containing protein SAMSN-1, mousemouse

Predictions only

Length 372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Samsn1P57725 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC27.2■■□□□ 1.94
Samsn1P57725 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Samsn1P57725 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Samsn1P57725 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Samsn1P57725 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Samsn1P57725 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Samsn1P57725 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Samsn1P57725 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Samsn1P57725 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
Samsn1P57725 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Samsn1P57725 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Samsn1P57725 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Samsn1P57725 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
Samsn1P57725 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Samsn1P57725 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
Samsn1P57725 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
Samsn1P57725 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
Samsn1P57725 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Samsn1P57725 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Samsn1P57725 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC27.1■■□□□ 1.93
Samsn1P57725 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Samsn1P57725 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
Samsn1P57725 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Samsn1P57725 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Samsn1P57725 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
Samsn1P57725 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
Samsn1P57725 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Samsn1P57725 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Samsn1P57725 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
Samsn1P57725 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC27.08■■□□□ 1.93
Samsn1P57725 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Samsn1P57725 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC27.06■■□□□ 1.92
Samsn1P57725 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Samsn1P57725 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
Samsn1P57725 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
Samsn1P57725 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC27.06■■□□□ 1.92
Samsn1P57725 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC27.05■■□□□ 1.92
Samsn1P57725 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
Samsn1P57725 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Samsn1P57725 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Samsn1P57725 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Samsn1P57725 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Samsn1P57725 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Samsn1P57725 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
Samsn1P57725 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Samsn1P57725 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Samsn1P57725 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
Samsn1P57725 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Samsn1P57725 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.92
Samsn1P57725 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Samsn1P57725 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
Samsn1P57725 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
Samsn1P57725 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Samsn1P57725 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Samsn1P57725 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Samsn1P57725 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Samsn1P57725 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
Samsn1P57725 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
Samsn1P57725 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
Samsn1P57725 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Samsn1P57725 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Samsn1P57725 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
Samsn1P57725 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
Samsn1P57725 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
Samsn1P57725 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.91
Samsn1P57725 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
Samsn1P57725 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Samsn1P57725 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Samsn1P57725 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Samsn1P57725 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
Samsn1P57725 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Samsn1P57725 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Samsn1P57725 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Samsn1P57725 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Samsn1P57725 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Samsn1P57725 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Samsn1P57725 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Samsn1P57725 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Samsn1P57725 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Samsn1P57725 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Samsn1P57725 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Samsn1P57725 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
Samsn1P57725 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Samsn1P57725 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Samsn1P57725 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Samsn1P57725 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Samsn1P57725 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
Samsn1P57725 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Samsn1P57725 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Samsn1P57725 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC26.85■■□□□ 1.89
Samsn1P57725 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Samsn1P57725 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Samsn1P57725 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Samsn1P57725 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Samsn1P57725 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Samsn1P57725 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Samsn1P57725 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Samsn1P57725 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Samsn1P57725 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Samsn1P57725 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.6 ms