Protein–RNA interactions for Protein: P56480

Atp5b, ATP synthase subunit beta, mitochondrial, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 529 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp5bP56480 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Atp5bP56480 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Atp5bP56480 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Atp5bP56480 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Atp5bP56480 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Atp5bP56480 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Atp5bP56480 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Atp5bP56480 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
Atp5bP56480 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Atp5bP56480 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC25■■□□□ 1.59
Atp5bP56480 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Atp5bP56480 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Atp5bP56480 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Atp5bP56480 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Atp5bP56480 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Atp5bP56480 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Atp5bP56480 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Atp5bP56480 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Atp5bP56480 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
Atp5bP56480 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
Atp5bP56480 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Atp5bP56480 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Atp5bP56480 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
Atp5bP56480 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Atp5bP56480 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Atp5bP56480 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Atp5bP56480 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Atp5bP56480 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Atp5bP56480 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Atp5bP56480 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Atp5bP56480 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Atp5bP56480 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Atp5bP56480 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Atp5bP56480 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Atp5bP56480 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Atp5bP56480 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Atp5bP56480 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Atp5bP56480 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
Atp5bP56480 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
Atp5bP56480 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC24.89■■□□□ 1.57
Atp5bP56480 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Atp5bP56480 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Atp5bP56480 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
Atp5bP56480 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Atp5bP56480 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Atp5bP56480 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
Atp5bP56480 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Atp5bP56480 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Atp5bP56480 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Atp5bP56480 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Atp5bP56480 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Atp5bP56480 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Atp5bP56480 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
Atp5bP56480 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Atp5bP56480 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Atp5bP56480 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Atp5bP56480 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Atp5bP56480 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Atp5bP56480 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Atp5bP56480 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Atp5bP56480 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Atp5bP56480 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Atp5bP56480 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Atp5bP56480 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Atp5bP56480 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Atp5bP56480 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Atp5bP56480 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Atp5bP56480 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Atp5bP56480 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Atp5bP56480 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Atp5bP56480 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Atp5bP56480 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Atp5bP56480 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Atp5bP56480 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Atp5bP56480 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Atp5bP56480 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Atp5bP56480 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Atp5bP56480 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Atp5bP56480 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Atp5bP56480 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Atp5bP56480 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Atp5bP56480 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Atp5bP56480 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Atp5bP56480 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Atp5bP56480 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Atp5bP56480 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Atp5bP56480 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Atp5bP56480 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Atp5bP56480 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Atp5bP56480 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Atp5bP56480 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Atp5bP56480 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Atp5bP56480 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Atp5bP56480 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Atp5bP56480 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Atp5bP56480 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Atp5bP56480 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Atp5bP56480 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Atp5bP56480 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Atp5bP56480 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 135.4 ms