Protein–RNA interactions for Protein: P55937

Golga3, Golgin subfamily A member 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,487 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Golga3P55937 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC42■■■■■ 4.31
Golga3P55937 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.99■■■■■ 4.31
Golga3P55937 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC41.98■■■■■ 4.31
Golga3P55937 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.97■■■■■ 4.31
Golga3P55937 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.94■■■■■ 4.3
Golga3P55937 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC41.94■■■■■ 4.3
Golga3P55937 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC41.94■■■■■ 4.3
Golga3P55937 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.93■■■■■ 4.3
Golga3P55937 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC41.92■■■■■ 4.3
Golga3P55937 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC41.91■■■■■ 4.3
Golga3P55937 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC41.9■■■■■ 4.3
Golga3P55937 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.89■■■■■ 4.3
Golga3P55937 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC41.89■■■■■ 4.3
Golga3P55937 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.87■■■■■ 4.29
Golga3P55937 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC41.86■■■■■ 4.29
Golga3P55937 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC41.86■■■■■ 4.29
Golga3P55937 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.85■■■■■ 4.29
Golga3P55937 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC41.85■■■■■ 4.29
Golga3P55937 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC41.84■■■■■ 4.29
Golga3P55937 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC41.83■■■■■ 4.29
Golga3P55937 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC41.82■■■■■ 4.28
Golga3P55937 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.81■■■■■ 4.28
Golga3P55937 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.81■■■■■ 4.28
Golga3P55937 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC41.8■■■■■ 4.28
Golga3P55937 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC41.8■■■■■ 4.28
Golga3P55937 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC41.79■■■■■ 4.28
Golga3P55937 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC41.78■■■■■ 4.28
Golga3P55937 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC41.76■■■■■ 4.28
Golga3P55937 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC41.76■■■■■ 4.28
Golga3P55937 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.76■■■■■ 4.28
Golga3P55937 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.75■■■■■ 4.27
Golga3P55937 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC41.74■■■■■ 4.27
Golga3P55937 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC41.74■■■■■ 4.27
Golga3P55937 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.74■■■■■ 4.27
Golga3P55937 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC41.73■■■■■ 4.27
Golga3P55937 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC41.68■■■■■ 4.26
Golga3P55937 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC41.68■■■■■ 4.26
Golga3P55937 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC41.68■■■■■ 4.26
Golga3P55937 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC41.66■■■■■ 4.26
Golga3P55937 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC41.66■■■■■ 4.26
Golga3P55937 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC41.66■■■■■ 4.26
Golga3P55937 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC41.65■■■■■ 4.26
Golga3P55937 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC41.64■■■■■ 4.26
Golga3P55937 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC41.63■■■■■ 4.25
Golga3P55937 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC41.62■■■■■ 4.25
Golga3P55937 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC41.62■■■■■ 4.25
Golga3P55937 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.6■■■■■ 4.25
Golga3P55937 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC41.6■■■■■ 4.25
Golga3P55937 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC41.59■■■■■ 4.25
Golga3P55937 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC41.58■■■■■ 4.25
Golga3P55937 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC41.58■■■■■ 4.25
Golga3P55937 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC41.57■■■■■ 4.25
Golga3P55937 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC41.57■■■■■ 4.24
Golga3P55937 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC41.56■■■■■ 4.24
Golga3P55937 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.55■■■■■ 4.24
Golga3P55937 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC41.53■■■■■ 4.24
Golga3P55937 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC41.53■■■■■ 4.24
Golga3P55937 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.53■■■■■ 4.24
Golga3P55937 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC41.51■■■■■ 4.24
Golga3P55937 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC41.48■■■■■ 4.23
Golga3P55937 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.48■■■■■ 4.23
Golga3P55937 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.48■■■■■ 4.23
Golga3P55937 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC41.48■■■■■ 4.23
Golga3P55937 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC41.47■■■■■ 4.23
Golga3P55937 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC41.47■■■■■ 4.23
Golga3P55937 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC41.47■■■■■ 4.23
Golga3P55937 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.46■■■■■ 4.23
Golga3P55937 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC41.44■■■■■ 4.22
Golga3P55937 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC41.43■■■■■ 4.22
Golga3P55937 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC41.43■■■■■ 4.22
Golga3P55937 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC41.42■■■■■ 4.22
Golga3P55937 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC41.42■■■■■ 4.22
Golga3P55937 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC41.41■■■■■ 4.22
Golga3P55937 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC41.4■■■■■ 4.22
Golga3P55937 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.39■■■■■ 4.22
Golga3P55937 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC41.39■■■■■ 4.22
Golga3P55937 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC41.39■■■■■ 4.22
Golga3P55937 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.38■■■■■ 4.21
Golga3P55937 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC41.38■■■■■ 4.21
Golga3P55937 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC41.38■■■■■ 4.21
Golga3P55937 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC41.37■■■■■ 4.21
Golga3P55937 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.36■■■■■ 4.21
Golga3P55937 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC41.35■■■■■ 4.21
Golga3P55937 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC41.34■■■■■ 4.21
Golga3P55937 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.34■■■■■ 4.21
Golga3P55937 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.34■■■■■ 4.21
Golga3P55937 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC41.34■■■■■ 4.21
Golga3P55937 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC41.31■■■■■ 4.2
Golga3P55937 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.3■■■■■ 4.2
Golga3P55937 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.3■■■■■ 4.2
Golga3P55937 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC41.3■■■■■ 4.2
Golga3P55937 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC41.29■■■■■ 4.2
Golga3P55937 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC41.28■■■■■ 4.2
Golga3P55937 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.27■■■■■ 4.2
Golga3P55937 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC41.27■■■■■ 4.2
Golga3P55937 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC41.27■■■■■ 4.2
Golga3P55937 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC41.27■■■■■ 4.2
Golga3P55937 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC41.26■■■■■ 4.2
Golga3P55937 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.26■■■■■ 4.2
Golga3P55937 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC41.24■■■■■ 4.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 98.4 ms