Protein–RNA interactions for Protein: P55194

Sh3bp1, SH3 domain-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 680 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bp1P55194 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Sh3bp1P55194 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Sh3bp1P55194 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Sh3bp1P55194 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Sh3bp1P55194 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Sh3bp1P55194 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Sh3bp1P55194 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Sh3bp1P55194 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
Sh3bp1P55194 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
Sh3bp1P55194 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Sh3bp1P55194 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Sh3bp1P55194 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Sh3bp1P55194 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Sh3bp1P55194 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Sh3bp1P55194 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Sh3bp1P55194 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
Sh3bp1P55194 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
Sh3bp1P55194 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
Sh3bp1P55194 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Sh3bp1P55194 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Sh3bp1P55194 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Sh3bp1P55194 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Sh3bp1P55194 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Sh3bp1P55194 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
Sh3bp1P55194 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Sh3bp1P55194 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Sh3bp1P55194 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
Sh3bp1P55194 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Sh3bp1P55194 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
Sh3bp1P55194 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
Sh3bp1P55194 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Sh3bp1P55194 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Sh3bp1P55194 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Sh3bp1P55194 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Sh3bp1P55194 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
Sh3bp1P55194 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Sh3bp1P55194 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
Sh3bp1P55194 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
Sh3bp1P55194 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Sh3bp1P55194 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Sh3bp1P55194 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Sh3bp1P55194 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
Sh3bp1P55194 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
Sh3bp1P55194 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC26.22■■□□□ 1.79
Sh3bp1P55194 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Sh3bp1P55194 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Sh3bp1P55194 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Sh3bp1P55194 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
Sh3bp1P55194 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
Sh3bp1P55194 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
Sh3bp1P55194 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Sh3bp1P55194 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Sh3bp1P55194 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Sh3bp1P55194 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Sh3bp1P55194 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Sh3bp1P55194 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Sh3bp1P55194 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Sh3bp1P55194 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Sh3bp1P55194 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Sh3bp1P55194 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Sh3bp1P55194 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Sh3bp1P55194 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Sh3bp1P55194 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Sh3bp1P55194 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
Sh3bp1P55194 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Sh3bp1P55194 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
Sh3bp1P55194 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
Sh3bp1P55194 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
Sh3bp1P55194 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
Sh3bp1P55194 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Sh3bp1P55194 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Sh3bp1P55194 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Sh3bp1P55194 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Sh3bp1P55194 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Sh3bp1P55194 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Sh3bp1P55194 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Sh3bp1P55194 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Sh3bp1P55194 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Sh3bp1P55194 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Sh3bp1P55194 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Sh3bp1P55194 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Sh3bp1P55194 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Sh3bp1P55194 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Sh3bp1P55194 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
Sh3bp1P55194 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Sh3bp1P55194 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Sh3bp1P55194 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Sh3bp1P55194 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Sh3bp1P55194 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Sh3bp1P55194 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Sh3bp1P55194 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Sh3bp1P55194 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Sh3bp1P55194 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Sh3bp1P55194 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Sh3bp1P55194 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Sh3bp1P55194 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Sh3bp1P55194 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Sh3bp1P55194 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Sh3bp1P55194 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
Sh3bp1P55194 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 78.4 ms