Protein–RNA interactions for Protein: P55097

Ctsk, Cathepsin K, mousemouse

Predictions only

Length 329 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CtskP55097 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CtskP55097 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CtskP55097 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CtskP55097 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CtskP55097 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CtskP55097 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CtskP55097 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CtskP55097 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CtskP55097 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CtskP55097 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CtskP55097 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CtskP55097 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CtskP55097 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CtskP55097 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CtskP55097 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CtskP55097 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CtskP55097 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CtskP55097 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CtskP55097 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CtskP55097 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CtskP55097 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CtskP55097 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CtskP55097 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CtskP55097 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CtskP55097 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CtskP55097 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CtskP55097 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
CtskP55097 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CtskP55097 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CtskP55097 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
CtskP55097 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CtskP55097 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CtskP55097 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CtskP55097 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CtskP55097 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CtskP55097 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CtskP55097 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CtskP55097 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CtskP55097 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CtskP55097 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CtskP55097 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CtskP55097 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CtskP55097 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CtskP55097 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CtskP55097 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CtskP55097 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
CtskP55097 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CtskP55097 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CtskP55097 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CtskP55097 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CtskP55097 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CtskP55097 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CtskP55097 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CtskP55097 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CtskP55097 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CtskP55097 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CtskP55097 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CtskP55097 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CtskP55097 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CtskP55097 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CtskP55097 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CtskP55097 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CtskP55097 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CtskP55097 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CtskP55097 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
CtskP55097 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CtskP55097 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CtskP55097 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CtskP55097 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CtskP55097 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CtskP55097 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CtskP55097 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CtskP55097 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
CtskP55097 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CtskP55097 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CtskP55097 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CtskP55097 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CtskP55097 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CtskP55097 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CtskP55097 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CtskP55097 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CtskP55097 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CtskP55097 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CtskP55097 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CtskP55097 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CtskP55097 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
CtskP55097 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CtskP55097 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CtskP55097 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
CtskP55097 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CtskP55097 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CtskP55097 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CtskP55097 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CtskP55097 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
CtskP55097 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
CtskP55097 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CtskP55097 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CtskP55097 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CtskP55097 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CtskP55097 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.5 ms