Protein–RNA interactions for Protein: P52795

Efnb1, Ephrin-B1, mousemouse

Predictions only

Length 345 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Efnb1P52795 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Efnb1P52795 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Efnb1P52795 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Efnb1P52795 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Efnb1P52795 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Efnb1P52795 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Efnb1P52795 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Efnb1P52795 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Efnb1P52795 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Efnb1P52795 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Efnb1P52795 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
Efnb1P52795 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Efnb1P52795 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Efnb1P52795 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Efnb1P52795 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
Efnb1P52795 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
Efnb1P52795 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Efnb1P52795 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Efnb1P52795 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Efnb1P52795 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Efnb1P52795 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Efnb1P52795 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Efnb1P52795 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Efnb1P52795 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Efnb1P52795 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Efnb1P52795 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Efnb1P52795 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Efnb1P52795 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Efnb1P52795 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Efnb1P52795 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Efnb1P52795 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Efnb1P52795 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Efnb1P52795 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Efnb1P52795 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Efnb1P52795 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Efnb1P52795 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Efnb1P52795 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Efnb1P52795 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Efnb1P52795 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Efnb1P52795 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Efnb1P52795 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Efnb1P52795 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Efnb1P52795 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Efnb1P52795 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Efnb1P52795 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Efnb1P52795 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Efnb1P52795 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Efnb1P52795 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Efnb1P52795 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Efnb1P52795 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Efnb1P52795 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.52■■□□□ 1.03
Efnb1P52795 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Efnb1P52795 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Efnb1P52795 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Efnb1P52795 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Efnb1P52795 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Efnb1P52795 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Efnb1P52795 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Efnb1P52795 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Efnb1P52795 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Efnb1P52795 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Efnb1P52795 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Efnb1P52795 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Efnb1P52795 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Efnb1P52795 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Efnb1P52795 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Efnb1P52795 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Efnb1P52795 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Efnb1P52795 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Efnb1P52795 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Efnb1P52795 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Efnb1P52795 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Efnb1P52795 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Efnb1P52795 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Efnb1P52795 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Efnb1P52795 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Efnb1P52795 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Efnb1P52795 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Efnb1P52795 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Efnb1P52795 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Efnb1P52795 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Efnb1P52795 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Efnb1P52795 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Efnb1P52795 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Efnb1P52795 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Efnb1P52795 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Efnb1P52795 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Efnb1P52795 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Efnb1P52795 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Efnb1P52795 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Efnb1P52795 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Efnb1P52795 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Efnb1P52795 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Efnb1P52795 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Efnb1P52795 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Efnb1P52795 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Efnb1P52795 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Efnb1P52795 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Efnb1P52795 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Efnb1P52795 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26 ms