Protein–RNA interactions for Protein: P52432

Polr1c, DNA-directed RNA polymerases I and III subunit RPAC1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 346 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Polr1cP52432 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Polr1cP52432 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Polr1cP52432 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Polr1cP52432 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Polr1cP52432 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Polr1cP52432 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Polr1cP52432 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
Polr1cP52432 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Polr1cP52432 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Polr1cP52432 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Polr1cP52432 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Polr1cP52432 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Polr1cP52432 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Polr1cP52432 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Polr1cP52432 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Polr1cP52432 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Polr1cP52432 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Polr1cP52432 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Polr1cP52432 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Polr1cP52432 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Polr1cP52432 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Polr1cP52432 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Polr1cP52432 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Polr1cP52432 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Polr1cP52432 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Polr1cP52432 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
Polr1cP52432 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Polr1cP52432 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Polr1cP52432 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Polr1cP52432 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Polr1cP52432 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Polr1cP52432 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Polr1cP52432 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Polr1cP52432 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Polr1cP52432 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Polr1cP52432 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Polr1cP52432 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Polr1cP52432 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Polr1cP52432 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Polr1cP52432 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Polr1cP52432 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Polr1cP52432 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Polr1cP52432 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Polr1cP52432 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.23
Polr1cP52432 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Polr1cP52432 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Polr1cP52432 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Polr1cP52432 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Polr1cP52432 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Polr1cP52432 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Polr1cP52432 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Polr1cP52432 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Polr1cP52432 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Polr1cP52432 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Polr1cP52432 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Polr1cP52432 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Polr1cP52432 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Polr1cP52432 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Polr1cP52432 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Polr1cP52432 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Polr1cP52432 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Polr1cP52432 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Polr1cP52432 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Polr1cP52432 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Polr1cP52432 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Polr1cP52432 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Polr1cP52432 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Polr1cP52432 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
Polr1cP52432 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Polr1cP52432 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Polr1cP52432 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Polr1cP52432 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Polr1cP52432 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Polr1cP52432 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Polr1cP52432 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Polr1cP52432 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Polr1cP52432 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Polr1cP52432 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Polr1cP52432 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Polr1cP52432 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Polr1cP52432 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Polr1cP52432 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Polr1cP52432 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Polr1cP52432 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Polr1cP52432 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Polr1cP52432 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Polr1cP52432 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Polr1cP52432 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Polr1cP52432 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Polr1cP52432 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Polr1cP52432 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Polr1cP52432 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Polr1cP52432 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Polr1cP52432 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Polr1cP52432 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Polr1cP52432 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Polr1cP52432 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Polr1cP52432 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Polr1cP52432 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Polr1cP52432 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.3 ms