Protein–RNA interactions for Protein: P52019

Sqle, Squalene monooxygenase, mousemouse

Predictions only

Length 572 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SqleP52019 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
SqleP52019 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
SqleP52019 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
SqleP52019 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC27.34■■□□□ 1.97
SqleP52019 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
SqleP52019 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
SqleP52019 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
SqleP52019 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
SqleP52019 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
SqleP52019 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
SqleP52019 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
SqleP52019 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC27.31■■□□□ 1.96
SqleP52019 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
SqleP52019 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
SqleP52019 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
SqleP52019 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
SqleP52019 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
SqleP52019 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
SqleP52019 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
SqleP52019 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.96
SqleP52019 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC27.26■■□□□ 1.95
SqleP52019 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
SqleP52019 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC27.25■■□□□ 1.95
SqleP52019 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
SqleP52019 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC27.23■■□□□ 1.95
SqleP52019 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
SqleP52019 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
SqleP52019 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC27.22■■□□□ 1.95
SqleP52019 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
SqleP52019 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
SqleP52019 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
SqleP52019 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
SqleP52019 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
SqleP52019 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
SqleP52019 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
SqleP52019 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
SqleP52019 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
SqleP52019 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
SqleP52019 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
SqleP52019 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
SqleP52019 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
SqleP52019 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
SqleP52019 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC27.17■■□□□ 1.94
SqleP52019 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
SqleP52019 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
SqleP52019 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
SqleP52019 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
SqleP52019 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
SqleP52019 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
SqleP52019 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
SqleP52019 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
SqleP52019 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
SqleP52019 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
SqleP52019 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
SqleP52019 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
SqleP52019 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
SqleP52019 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC27.07■■□□□ 1.92
SqleP52019 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
SqleP52019 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
SqleP52019 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
SqleP52019 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
SqleP52019 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
SqleP52019 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
SqleP52019 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
SqleP52019 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
SqleP52019 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
SqleP52019 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
SqleP52019 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
SqleP52019 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
SqleP52019 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
SqleP52019 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
SqleP52019 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
SqleP52019 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
SqleP52019 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
SqleP52019 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
SqleP52019 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
SqleP52019 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
SqleP52019 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
SqleP52019 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
SqleP52019 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
SqleP52019 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
SqleP52019 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
SqleP52019 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
SqleP52019 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
SqleP52019 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC27■■□□□ 1.91
SqleP52019 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
SqleP52019 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
SqleP52019 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
SqleP52019 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
SqleP52019 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
SqleP52019 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
SqleP52019 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
SqleP52019 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
SqleP52019 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
SqleP52019 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
SqleP52019 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
SqleP52019 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
SqleP52019 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
SqleP52019 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
SqleP52019 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.4 ms