Protein–RNA interactions for Protein: P49813

Tmod1, Tropomodulin-1, mousemouse

Predictions only

Length 359 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmod1P49813 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.91
Tmod1P49813 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Tmod1P49813 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Tmod1P49813 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Tmod1P49813 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Tmod1P49813 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC26.93■■□□□ 1.9
Tmod1P49813 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Tmod1P49813 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Tmod1P49813 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.91■■□□□ 1.9
Tmod1P49813 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Tmod1P49813 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Tmod1P49813 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC26.89■■□□□ 1.9
Tmod1P49813 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Tmod1P49813 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Tmod1P49813 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
Tmod1P49813 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Tmod1P49813 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Tmod1P49813 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Tmod1P49813 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Tmod1P49813 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Tmod1P49813 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Tmod1P49813 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
Tmod1P49813 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
Tmod1P49813 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Tmod1P49813 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Tmod1P49813 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Tmod1P49813 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Tmod1P49813 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Tmod1P49813 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Tmod1P49813 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Tmod1P49813 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Tmod1P49813 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
Tmod1P49813 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
Tmod1P49813 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Tmod1P49813 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Tmod1P49813 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Tmod1P49813 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Tmod1P49813 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Tmod1P49813 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Tmod1P49813 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Tmod1P49813 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Tmod1P49813 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
Tmod1P49813 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Tmod1P49813 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Tmod1P49813 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
Tmod1P49813 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
Tmod1P49813 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
Tmod1P49813 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
Tmod1P49813 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.87
Tmod1P49813 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
Tmod1P49813 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC26.7■■□□□ 1.86
Tmod1P49813 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Tmod1P49813 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Tmod1P49813 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
Tmod1P49813 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Tmod1P49813 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
Tmod1P49813 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC26.68■■□□□ 1.86
Tmod1P49813 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Tmod1P49813 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Tmod1P49813 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
Tmod1P49813 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Tmod1P49813 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
Tmod1P49813 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
Tmod1P49813 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC26.65■■□□□ 1.86
Tmod1P49813 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
Tmod1P49813 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
Tmod1P49813 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
Tmod1P49813 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Tmod1P49813 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Tmod1P49813 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Tmod1P49813 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Tmod1P49813 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
Tmod1P49813 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Tmod1P49813 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Tmod1P49813 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
Tmod1P49813 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Tmod1P49813 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Tmod1P49813 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Tmod1P49813 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
Tmod1P49813 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Tmod1P49813 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Tmod1P49813 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC26.58■■□□□ 1.85
Tmod1P49813 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Tmod1P49813 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
Tmod1P49813 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.84
Tmod1P49813 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Tmod1P49813 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
Tmod1P49813 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
Tmod1P49813 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Tmod1P49813 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Tmod1P49813 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Tmod1P49813 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Tmod1P49813 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
Tmod1P49813 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Tmod1P49813 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Tmod1P49813 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Tmod1P49813 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Tmod1P49813 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
Tmod1P49813 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
Tmod1P49813 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
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