Protein–RNA interactions for Protein: P49183

Dnase1, Deoxyribonuclease-1, mousemouse

Predictions only

Length 284 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dnase1P49183 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Dnase1P49183 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Dnase1P49183 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Dnase1P49183 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Dnase1P49183 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Dnase1P49183 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Dnase1P49183 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Dnase1P49183 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Dnase1P49183 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Dnase1P49183 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
Dnase1P49183 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Dnase1P49183 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Dnase1P49183 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
Dnase1P49183 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Dnase1P49183 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Dnase1P49183 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Dnase1P49183 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Dnase1P49183 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Dnase1P49183 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Dnase1P49183 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Dnase1P49183 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Dnase1P49183 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Dnase1P49183 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Dnase1P49183 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Dnase1P49183 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Dnase1P49183 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Dnase1P49183 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Dnase1P49183 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Dnase1P49183 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Dnase1P49183 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Dnase1P49183 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Dnase1P49183 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Dnase1P49183 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Dnase1P49183 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Dnase1P49183 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Dnase1P49183 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Dnase1P49183 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Dnase1P49183 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Dnase1P49183 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Dnase1P49183 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Dnase1P49183 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Dnase1P49183 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Dnase1P49183 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Dnase1P49183 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Dnase1P49183 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Dnase1P49183 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Dnase1P49183 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Dnase1P49183 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Dnase1P49183 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Dnase1P49183 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Dnase1P49183 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Dnase1P49183 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Dnase1P49183 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Dnase1P49183 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Dnase1P49183 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Dnase1P49183 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Dnase1P49183 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Dnase1P49183 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Dnase1P49183 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Dnase1P49183 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Dnase1P49183 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Dnase1P49183 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Dnase1P49183 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Dnase1P49183 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Dnase1P49183 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Dnase1P49183 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Dnase1P49183 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Dnase1P49183 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Dnase1P49183 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Dnase1P49183 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Dnase1P49183 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Dnase1P49183 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Dnase1P49183 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Dnase1P49183 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Dnase1P49183 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Dnase1P49183 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Dnase1P49183 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Dnase1P49183 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Dnase1P49183 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Dnase1P49183 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Dnase1P49183 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Dnase1P49183 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Dnase1P49183 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Dnase1P49183 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Dnase1P49183 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Dnase1P49183 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Dnase1P49183 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Dnase1P49183 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Dnase1P49183 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Dnase1P49183 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Dnase1P49183 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
Dnase1P49183 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
Dnase1P49183 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Dnase1P49183 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Dnase1P49183 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Dnase1P49183 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Dnase1P49183 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Dnase1P49183 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Dnase1P49183 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Dnase1P49183 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 86.8 ms