Protein–RNA interactions for Protein: P48772

Cox8b, Cytochrome c oxidase subunit 8B, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 70 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cox8bP48772 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Cox8bP48772 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Cox8bP48772 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Cox8bP48772 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Cox8bP48772 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Cox8bP48772 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Cox8bP48772 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Cox8bP48772 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Cox8bP48772 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Cox8bP48772 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Cox8bP48772 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Cox8bP48772 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Cox8bP48772 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Cox8bP48772 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Cox8bP48772 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Cox8bP48772 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Cox8bP48772 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Cox8bP48772 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Cox8bP48772 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Cox8bP48772 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Cox8bP48772 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Cox8bP48772 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Cox8bP48772 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Cox8bP48772 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Cox8bP48772 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Cox8bP48772 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Cox8bP48772 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Cox8bP48772 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Cox8bP48772 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Cox8bP48772 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Cox8bP48772 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Cox8bP48772 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Cox8bP48772 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Cox8bP48772 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Cox8bP48772 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Cox8bP48772 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Cox8bP48772 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Cox8bP48772 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Cox8bP48772 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Cox8bP48772 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Cox8bP48772 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Cox8bP48772 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Cox8bP48772 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Cox8bP48772 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Cox8bP48772 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Cox8bP48772 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Cox8bP48772 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cox8bP48772 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cox8bP48772 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cox8bP48772 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cox8bP48772 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cox8bP48772 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cox8bP48772 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cox8bP48772 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cox8bP48772 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cox8bP48772 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cox8bP48772 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cox8bP48772 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cox8bP48772 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cox8bP48772 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cox8bP48772 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cox8bP48772 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cox8bP48772 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cox8bP48772 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cox8bP48772 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cox8bP48772 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cox8bP48772 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Cox8bP48772 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Cox8bP48772 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Cox8bP48772 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Cox8bP48772 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Cox8bP48772 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Cox8bP48772 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Cox8bP48772 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Cox8bP48772 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Cox8bP48772 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cox8bP48772 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cox8bP48772 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cox8bP48772 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Cox8bP48772 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Cox8bP48772 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Cox8bP48772 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Cox8bP48772 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Cox8bP48772 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Cox8bP48772 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Cox8bP48772 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Cox8bP48772 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Cox8bP48772 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Cox8bP48772 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Cox8bP48772 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Cox8bP48772 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Cox8bP48772 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Cox8bP48772 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Cox8bP48772 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Cox8bP48772 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Cox8bP48772 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Cox8bP48772 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Cox8bP48772 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Cox8bP48772 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Cox8bP48772 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.6 ms