Protein–RNA interactions for Protein: P48410

Abcd1, ATP-binding cassette sub-family D member 1, mousemouse

Predictions only

Length 736 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abcd1P48410 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
Abcd1P48410 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
Abcd1P48410 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Abcd1P48410 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
Abcd1P48410 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Abcd1P48410 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Abcd1P48410 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Abcd1P48410 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC26.71■■□□□ 1.87
Abcd1P48410 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Abcd1P48410 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Abcd1P48410 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Abcd1P48410 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.87
Abcd1P48410 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Abcd1P48410 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Abcd1P48410 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
Abcd1P48410 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Abcd1P48410 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
Abcd1P48410 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
Abcd1P48410 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Abcd1P48410 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Abcd1P48410 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Abcd1P48410 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Abcd1P48410 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Abcd1P48410 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Abcd1P48410 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Abcd1P48410 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Abcd1P48410 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Abcd1P48410 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Abcd1P48410 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Abcd1P48410 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Abcd1P48410 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Abcd1P48410 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC26.61■■□□□ 1.85
Abcd1P48410 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Abcd1P48410 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Abcd1P48410 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Abcd1P48410 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Abcd1P48410 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Abcd1P48410 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Abcd1P48410 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Abcd1P48410 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Abcd1P48410 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Abcd1P48410 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Abcd1P48410 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Abcd1P48410 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
Abcd1P48410 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
Abcd1P48410 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC26.53■■□□□ 1.84
Abcd1P48410 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Abcd1P48410 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Abcd1P48410 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Abcd1P48410 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC26.51■■□□□ 1.83
Abcd1P48410 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
Abcd1P48410 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Abcd1P48410 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
Abcd1P48410 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Abcd1P48410 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Abcd1P48410 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
Abcd1P48410 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Abcd1P48410 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
Abcd1P48410 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Abcd1P48410 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Abcd1P48410 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
Abcd1P48410 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Abcd1P48410 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Abcd1P48410 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Abcd1P48410 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Abcd1P48410 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC26.44■■□□□ 1.82
Abcd1P48410 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Abcd1P48410 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Abcd1P48410 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Abcd1P48410 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Abcd1P48410 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Abcd1P48410 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Abcd1P48410 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
Abcd1P48410 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Abcd1P48410 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
Abcd1P48410 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Abcd1P48410 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
Abcd1P48410 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC26.4■■□□□ 1.82
Abcd1P48410 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
Abcd1P48410 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Abcd1P48410 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Abcd1P48410 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC26.39■■□□□ 1.82
Abcd1P48410 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
Abcd1P48410 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
Abcd1P48410 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
Abcd1P48410 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Abcd1P48410 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
Abcd1P48410 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Abcd1P48410 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Abcd1P48410 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Abcd1P48410 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Abcd1P48410 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Abcd1P48410 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Abcd1P48410 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Abcd1P48410 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
Abcd1P48410 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Abcd1P48410 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Abcd1P48410 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC26.33■■□□□ 1.81
Abcd1P48410 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Abcd1P48410 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.8 ms