Protein–RNA interactions for Protein: P47746

Cnr1, Cannabinoid receptor 1, mousemouse

Predictions only

Length 473 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnr1P47746 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cnr1P47746 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cnr1P47746 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cnr1P47746 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Cnr1P47746 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cnr1P47746 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cnr1P47746 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cnr1P47746 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cnr1P47746 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cnr1P47746 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cnr1P47746 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cnr1P47746 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cnr1P47746 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cnr1P47746 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Cnr1P47746 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cnr1P47746 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cnr1P47746 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cnr1P47746 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cnr1P47746 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cnr1P47746 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cnr1P47746 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cnr1P47746 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cnr1P47746 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Cnr1P47746 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cnr1P47746 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cnr1P47746 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cnr1P47746 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cnr1P47746 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cnr1P47746 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cnr1P47746 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cnr1P47746 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cnr1P47746 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cnr1P47746 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cnr1P47746 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cnr1P47746 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Cnr1P47746 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cnr1P47746 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cnr1P47746 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cnr1P47746 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Cnr1P47746 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Cnr1P47746 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cnr1P47746 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cnr1P47746 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Cnr1P47746 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Cnr1P47746 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Cnr1P47746 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Cnr1P47746 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Cnr1P47746 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Cnr1P47746 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Cnr1P47746 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Cnr1P47746 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Cnr1P47746 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Cnr1P47746 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Cnr1P47746 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Cnr1P47746 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Cnr1P47746 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
Cnr1P47746 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Cnr1P47746 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Cnr1P47746 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Cnr1P47746 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Cnr1P47746 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Cnr1P47746 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Cnr1P47746 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Cnr1P47746 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Cnr1P47746 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Cnr1P47746 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Cnr1P47746 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Cnr1P47746 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Cnr1P47746 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Cnr1P47746 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Cnr1P47746 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Cnr1P47746 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Cnr1P47746 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Cnr1P47746 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Cnr1P47746 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Cnr1P47746 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Cnr1P47746 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Cnr1P47746 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Cnr1P47746 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Cnr1P47746 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Cnr1P47746 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Cnr1P47746 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Cnr1P47746 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Cnr1P47746 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Cnr1P47746 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Cnr1P47746 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Cnr1P47746 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Cnr1P47746 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Cnr1P47746 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
Cnr1P47746 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Cnr1P47746 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Cnr1P47746 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Cnr1P47746 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Cnr1P47746 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Cnr1P47746 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Cnr1P47746 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Cnr1P47746 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Cnr1P47746 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Cnr1P47746 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Cnr1P47746 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.1 ms